|
a |
|
b/AICare-baselines/configs/exp.py |
|
|
1 |
hparams = [ |
|
|
2 |
{ |
|
|
3 |
"model": "CatBoost", |
|
|
4 |
"dataset": "mimic-iv", |
|
|
5 |
"task": "outcome", |
|
|
6 |
"max_depth": 5, |
|
|
7 |
"n_estimators": 50, |
|
|
8 |
"learning_rate": 0.1, |
|
|
9 |
"batch_size": 81920, |
|
|
10 |
"main_metric": "auprc", |
|
|
11 |
}, |
|
|
12 |
{ |
|
|
13 |
"model": "XGBoost", |
|
|
14 |
"dataset": "mimic-iv", |
|
|
15 |
"task": "outcome", |
|
|
16 |
"max_depth": 5, |
|
|
17 |
"n_estimators": 50, |
|
|
18 |
"learning_rate": 0.1, |
|
|
19 |
"batch_size": 81920, |
|
|
20 |
"main_metric": "auprc", |
|
|
21 |
}, |
|
|
22 |
{ |
|
|
23 |
'model': 'GRU', |
|
|
24 |
'dataset': 'mimic-iv', |
|
|
25 |
'task': 'outcome', |
|
|
26 |
'epochs': 50, |
|
|
27 |
'patience': 10, |
|
|
28 |
'batch_size': 1024, |
|
|
29 |
'learning_rate': 0.001, |
|
|
30 |
'main_metric': 'auprc', |
|
|
31 |
'demo_dim': 2, |
|
|
32 |
'lab_dim': 59, |
|
|
33 |
'hidden_dim': 128, |
|
|
34 |
'output_dim': 1 |
|
|
35 |
}, |
|
|
36 |
{ |
|
|
37 |
'model': 'AdaCare', |
|
|
38 |
'dataset': 'mimic-iv', |
|
|
39 |
'task': 'outcome', |
|
|
40 |
'epochs': 50, |
|
|
41 |
'patience': 10, |
|
|
42 |
'batch_size': 1024, |
|
|
43 |
'learning_rate': 0.001, |
|
|
44 |
'main_metric': 'auprc', |
|
|
45 |
'demo_dim': 2, |
|
|
46 |
'lab_dim': 59, |
|
|
47 |
'hidden_dim': 128, |
|
|
48 |
'output_dim': 1 |
|
|
49 |
}, |
|
|
50 |
{ |
|
|
51 |
"model": "CatBoost", |
|
|
52 |
"dataset": "tjh", |
|
|
53 |
"task": "outcome", |
|
|
54 |
"max_depth": 5, |
|
|
55 |
"n_estimators": 50, |
|
|
56 |
"learning_rate": 0.1, |
|
|
57 |
"batch_size": 81920, |
|
|
58 |
"main_metric": "auprc", |
|
|
59 |
}, |
|
|
60 |
{ |
|
|
61 |
"model": "XGBoost", |
|
|
62 |
"dataset": "tjh", |
|
|
63 |
"task": "outcome", |
|
|
64 |
"max_depth": 5, |
|
|
65 |
"n_estimators": 50, |
|
|
66 |
"learning_rate": 0.1, |
|
|
67 |
"batch_size": 81920, |
|
|
68 |
"main_metric": "auprc", |
|
|
69 |
}, |
|
|
70 |
{ |
|
|
71 |
'model': 'GRU', |
|
|
72 |
'dataset': 'tjh', |
|
|
73 |
'task': 'outcome', |
|
|
74 |
'epochs': 50, |
|
|
75 |
'patience': 10, |
|
|
76 |
'batch_size': 1024, |
|
|
77 |
'learning_rate': 0.001, |
|
|
78 |
'main_metric': 'auprc', |
|
|
79 |
'demo_dim': 2, |
|
|
80 |
'lab_dim': 73, |
|
|
81 |
'hidden_dim': 128, |
|
|
82 |
'output_dim': 1 |
|
|
83 |
}, |
|
|
84 |
{ |
|
|
85 |
'model': 'AdaCare', |
|
|
86 |
'dataset': 'tjh', |
|
|
87 |
'task': 'outcome', |
|
|
88 |
'epochs': 50, |
|
|
89 |
'patience': 10, |
|
|
90 |
'batch_size': 1024, |
|
|
91 |
'learning_rate': 0.001, |
|
|
92 |
'main_metric': 'auprc', |
|
|
93 |
'demo_dim': 2, |
|
|
94 |
'lab_dim': 73, |
|
|
95 |
'hidden_dim': 128, |
|
|
96 |
'output_dim': 1 |
|
|
97 |
}, |
|
|
98 |
{ |
|
|
99 |
"model": "GBDT", |
|
|
100 |
"dataset": "mimic-iv", |
|
|
101 |
"task": "outcome", |
|
|
102 |
"max_depth": 5, |
|
|
103 |
"n_estimators": 100, |
|
|
104 |
"learning_rate": 0.1, |
|
|
105 |
"batch_size": 81920, |
|
|
106 |
"main_metric": "auprc", |
|
|
107 |
}, |
|
|
108 |
{ |
|
|
109 |
"model": "GBDT", |
|
|
110 |
"dataset": "tjh", |
|
|
111 |
"task": "outcome", |
|
|
112 |
"max_depth": 5, |
|
|
113 |
"n_estimators": 100, |
|
|
114 |
"learning_rate": 0.1, |
|
|
115 |
"batch_size": 81920, |
|
|
116 |
"main_metric": "auprc", |
|
|
117 |
}, |
|
|
118 |
{ |
|
|
119 |
"model": "RF", |
|
|
120 |
"dataset": "mimic-iv", |
|
|
121 |
"task": "outcome", |
|
|
122 |
"max_depth": 15, |
|
|
123 |
"n_estimators": 100, |
|
|
124 |
"learning_rate": 1.0, |
|
|
125 |
"batch_size": 81920, |
|
|
126 |
"main_metric": "auprc", |
|
|
127 |
}, |
|
|
128 |
{ |
|
|
129 |
"model": "RF", |
|
|
130 |
"dataset": "tjh", |
|
|
131 |
"task": "outcome", |
|
|
132 |
"max_depth": 15, |
|
|
133 |
"n_estimators": 100, |
|
|
134 |
"learning_rate": 1.0, |
|
|
135 |
"batch_size": 81920, |
|
|
136 |
"main_metric": "auprc", |
|
|
137 |
}, |
|
|
138 |
{ |
|
|
139 |
'model': 'StageNet', |
|
|
140 |
'dataset': 'mimic-iv', |
|
|
141 |
'task': 'outcome', |
|
|
142 |
'epochs': 50, |
|
|
143 |
'patience': 10, |
|
|
144 |
'batch_size': 1024, |
|
|
145 |
'learning_rate': 0.001, |
|
|
146 |
'main_metric': 'auprc', |
|
|
147 |
'demo_dim': 2, |
|
|
148 |
'lab_dim': 59, |
|
|
149 |
'hidden_dim': 128, |
|
|
150 |
'output_dim': 1 |
|
|
151 |
}, |
|
|
152 |
{ |
|
|
153 |
'model': 'StageNet', |
|
|
154 |
'dataset': 'tjh', |
|
|
155 |
'task': 'outcome', |
|
|
156 |
'epochs': 50, |
|
|
157 |
'patience': 10, |
|
|
158 |
'batch_size': 1024, |
|
|
159 |
'learning_rate': 0.001, |
|
|
160 |
'main_metric': 'auprc', |
|
|
161 |
'demo_dim': 2, |
|
|
162 |
'lab_dim': 73, |
|
|
163 |
'hidden_dim': 128, |
|
|
164 |
'output_dim': 1 |
|
|
165 |
}, |
|
|
166 |
{ |
|
|
167 |
'model': 'TCN', |
|
|
168 |
'dataset': 'mimic-iv', |
|
|
169 |
'task': 'outcome', |
|
|
170 |
'epochs': 50, |
|
|
171 |
'patience': 10, |
|
|
172 |
'batch_size': 1024, |
|
|
173 |
'learning_rate': 0.001, |
|
|
174 |
'main_metric': 'auprc', |
|
|
175 |
'demo_dim': 2, |
|
|
176 |
'lab_dim': 59, |
|
|
177 |
'hidden_dim': 128, |
|
|
178 |
'output_dim': 1 |
|
|
179 |
}, |
|
|
180 |
{ |
|
|
181 |
'model': 'TCN', |
|
|
182 |
'dataset': 'tjh', |
|
|
183 |
'task': 'outcome', |
|
|
184 |
'epochs': 50, |
|
|
185 |
'patience': 10, |
|
|
186 |
'batch_size': 1024, |
|
|
187 |
'learning_rate': 0.001, |
|
|
188 |
'main_metric': 'auprc', |
|
|
189 |
'demo_dim': 2, |
|
|
190 |
'lab_dim': 73, |
|
|
191 |
'hidden_dim': 128, |
|
|
192 |
'output_dim': 1 |
|
|
193 |
}, |
|
|
194 |
{ |
|
|
195 |
'model': 'AICare', |
|
|
196 |
'dataset': 'mimic-iv', |
|
|
197 |
'task': 'outcome', |
|
|
198 |
'epochs': 50, |
|
|
199 |
'patience': 10, |
|
|
200 |
'batch_size': 1024, |
|
|
201 |
'learning_rate': 0.001, |
|
|
202 |
'main_metric': 'auprc', |
|
|
203 |
'demo_dim': 2, |
|
|
204 |
'lab_dim': 59, |
|
|
205 |
'hidden_dim': 128, |
|
|
206 |
'output_dim': 1 |
|
|
207 |
}, |
|
|
208 |
{ |
|
|
209 |
'model': 'AICare', |
|
|
210 |
'dataset': 'tjh', |
|
|
211 |
'task': 'outcome', |
|
|
212 |
'epochs': 50, |
|
|
213 |
'patience': 10, |
|
|
214 |
'batch_size': 1024, |
|
|
215 |
'learning_rate': 0.001, |
|
|
216 |
'main_metric': 'auprc', |
|
|
217 |
'demo_dim': 2, |
|
|
218 |
'lab_dim': 73, |
|
|
219 |
'hidden_dim': 128, |
|
|
220 |
'output_dim': 1 |
|
|
221 |
}, |
|
|
222 |
{ |
|
|
223 |
'model': 'RETAIN', |
|
|
224 |
'dataset': 'mimic-iv', |
|
|
225 |
'task': 'outcome', |
|
|
226 |
'epochs': 50, |
|
|
227 |
'patience': 10, |
|
|
228 |
'batch_size': 1024, |
|
|
229 |
'learning_rate': 0.001, |
|
|
230 |
'main_metric': 'auprc', |
|
|
231 |
'demo_dim': 2, |
|
|
232 |
'lab_dim': 59, |
|
|
233 |
'hidden_dim': 128, |
|
|
234 |
'output_dim': 1 |
|
|
235 |
}, |
|
|
236 |
{ |
|
|
237 |
'model': 'RETAIN', |
|
|
238 |
'dataset': 'tjh', |
|
|
239 |
'task': 'outcome', |
|
|
240 |
'epochs': 50, |
|
|
241 |
'patience': 10, |
|
|
242 |
'batch_size': 1024, |
|
|
243 |
'learning_rate': 0.001, |
|
|
244 |
'main_metric': 'auprc', |
|
|
245 |
'demo_dim': 2, |
|
|
246 |
'lab_dim': 73, |
|
|
247 |
'hidden_dim': 128, |
|
|
248 |
'output_dim': 1 |
|
|
249 |
}, |
|
|
250 |
{ |
|
|
251 |
"model": "DT", |
|
|
252 |
"dataset": "mimic-iv", |
|
|
253 |
"task": "outcome", |
|
|
254 |
"max_depth": 5, |
|
|
255 |
"n_estimators": 10, |
|
|
256 |
"learning_rate": 0.01, |
|
|
257 |
"batch_size": 81920, |
|
|
258 |
"main_metric": "auprc", |
|
|
259 |
}, |
|
|
260 |
{ |
|
|
261 |
"model": "DT", |
|
|
262 |
"dataset": "tjh", |
|
|
263 |
"task": "outcome", |
|
|
264 |
"max_depth": 5, |
|
|
265 |
"n_estimators": 10, |
|
|
266 |
"learning_rate": 0.01, |
|
|
267 |
"batch_size": 81920, |
|
|
268 |
"main_metric": "auprc", |
|
|
269 |
}, |
|
|
270 |
|
|
|
271 |
] |