24 lines (21 with data), 851 Bytes

{% if messages[0]['role'] == 'system' %}
    {% set system_message = '<<SYS>>\n' + messages[0]['content'] | trim + '\n<</SYS>>\n\n' %}
    {% set messages = messages[1:] %}
{% else %}
    {% set system_message = '' %}
{% endif %}

{% for message in messages %}
    {% if (message['role'] == 'user') != (loop.index0 % 2 == 0) %}
        {{ raise_exception('Conversation roles must alternate user/assistant/user/assistant/...') }}
    {% endif %}

    {% if loop.index0 == 0 %}
        {% set content = system_message + message['content'] %}
    {% else %}
        {% set content = message['content'] %}
    {% endif %}

    {% if message['role'] == 'user' %}
        {{ bos_token + '[INST] ' + content | trim + ' [/INST]' }}
    {% elif message['role'] == 'assistant' %}
        {{ ' ' + content | trim + ' ' + eos_token }}
    {% endif %}
{% endfor %}