19 lines (17 with data), 690 Bytes

{% if messages[0]['role'] == 'system' %}
    {% set system_message = messages[0]['content'] | trim + '\n\n' %}
    {% set messages = messages[1:] %}
{% else %}
    {% set system_message = '' %}
{% endif %}

{{ bos_token + system_message}}
{% for message in messages %}
    {% if (message['role'] == 'user') != (loop.index0 % 2 == 0) %}
        {{ raise_exception('Conversation roles must alternate user/assistant/user/assistant/...') }}
    {% endif %}

    {% if message['role'] == 'user' %}
        {{ '[INST] ' + message['content'] | trim + ' [/INST]' }}
    {% elif message['role'] == 'assistant' %}
        {{ ' ' + message['content'] | trim + eos_token }}
    {% endif %}
{% endfor %}