Diff of
/base_config.json
[000000]
..
[79668b]
Switch to unified view
| a | b/base_config.json | ||
|---|---|---|---|
| 1 | { |
||
| 2 | "adjacent_annotations_slack": "[\\. \\-]?[\\. ]?", |
||
| 3 | "resolve_overlap_strategy": { |
||
| 4 | "attributes": [ |
||
| 5 | "priority", |
||
| 6 | "length" |
||
| 7 | ], |
||
| 8 | "ascending": [ |
||
| 9 | false, |
||
| 10 | false |
||
| 11 | ] |
||
| 12 | }, |
||
| 13 | "redactor_open_char": "[", |
||
| 14 | "redactor_close_char": "]", |
||
| 15 | "annotators": { |
||
| 16 | "prefix_with_initial": { |
||
| 17 | "annotator_type": "deduce.annotator.TokenPatternAnnotator", |
||
| 18 | "group": "names", |
||
| 19 | "args": { |
||
| 20 | "tag": "prefix+initiaal", |
||
| 21 | "skip": ["."], |
||
| 22 | "pattern": [ |
||
| 23 | { |
||
| 24 | "lookup": "prefix" |
||
| 25 | }, |
||
| 26 | { |
||
| 27 | "or": [ |
||
| 28 | { |
||
| 29 | "lookup": "initial" |
||
| 30 | }, |
||
| 31 | { |
||
| 32 | "is_initials": true |
||
| 33 | } |
||
| 34 | ] |
||
| 35 | } |
||
| 36 | ] |
||
| 37 | } |
||
| 38 | }, |
||
| 39 | "prefix_with_interfix": { |
||
| 40 | "annotator_type": "deduce.annotator.TokenPatternAnnotator", |
||
| 41 | "group": "names", |
||
| 42 | "args": { |
||
| 43 | "tag": "prefix+interfix+naam", |
||
| 44 | "skip": ["."], |
||
| 45 | "pattern": [ |
||
| 46 | { |
||
| 47 | "lookup": "prefix" |
||
| 48 | }, |
||
| 49 | { |
||
| 50 | "lookup": "interfix" |
||
| 51 | }, |
||
| 52 | { |
||
| 53 | "like_name": true |
||
| 54 | } |
||
| 55 | ] |
||
| 56 | } |
||
| 57 | }, |
||
| 58 | "prefix_with_name": { |
||
| 59 | "annotator_type": "deduce.annotator.TokenPatternAnnotator", |
||
| 60 | "group": "names", |
||
| 61 | "args": { |
||
| 62 | "tag": "prefix+naam", |
||
| 63 | "skip": ["."], |
||
| 64 | "pattern": [ |
||
| 65 | { |
||
| 66 | "lookup": "prefix" |
||
| 67 | }, |
||
| 68 | { |
||
| 69 | "and": [ |
||
| 70 | { |
||
| 71 | "like_name": true |
||
| 72 | }, |
||
| 73 | { |
||
| 74 | "neg_lookup": "whitelist" |
||
| 75 | } |
||
| 76 | ] |
||
| 77 | } |
||
| 78 | ] |
||
| 79 | } |
||
| 80 | }, |
||
| 81 | "interfix_with_name": { |
||
| 82 | "annotator_type": "deduce.annotator.TokenPatternAnnotator", |
||
| 83 | "group": "names", |
||
| 84 | "args": { |
||
| 85 | "tag": "interfix+achternaam", |
||
| 86 | "skip": [], |
||
| 87 | "pattern": [ |
||
| 88 | { |
||
| 89 | "lookup": "interfix" |
||
| 90 | }, |
||
| 91 | { |
||
| 92 | "and": [ |
||
| 93 | { |
||
| 94 | "lookup": "interfix_surname" |
||
| 95 | }, |
||
| 96 | { |
||
| 97 | "neg_lookup": "whitelist" |
||
| 98 | } |
||
| 99 | ] |
||
| 100 | } |
||
| 101 | ] |
||
| 102 | } |
||
| 103 | }, |
||
| 104 | "initial_with_name": { |
||
| 105 | "annotator_type": "deduce.annotator.TokenPatternAnnotator", |
||
| 106 | "group": "names", |
||
| 107 | "args": { |
||
| 108 | "tag": "initiaal+naam", |
||
| 109 | "skip": ["."], |
||
| 110 | "pattern": [ |
||
| 111 | { |
||
| 112 | "lookup": "initial" |
||
| 113 | }, |
||
| 114 | { |
||
| 115 | "and": [ |
||
| 116 | { |
||
| 117 | "like_name": true |
||
| 118 | }, |
||
| 119 | { |
||
| 120 | "neg_lookup": "whitelist" |
||
| 121 | }, |
||
| 122 | { |
||
| 123 | "neg_lookup": "prefix" |
||
| 124 | } |
||
| 125 | ] |
||
| 126 | } |
||
| 127 | ] |
||
| 128 | } |
||
| 129 | }, |
||
| 130 | "initial_interfix": { |
||
| 131 | "annotator_type": "deduce.annotator.TokenPatternAnnotator", |
||
| 132 | "group": "names", |
||
| 133 | "args": { |
||
| 134 | "tag": "initiaal+interfix+naam", |
||
| 135 | "skip": ["."], |
||
| 136 | "pattern": [ |
||
| 137 | { |
||
| 138 | "lookup": "initial" |
||
| 139 | }, |
||
| 140 | { |
||
| 141 | "lookup": "interfix" |
||
| 142 | }, |
||
| 143 | { |
||
| 144 | "like_name": true |
||
| 145 | } |
||
| 146 | ] |
||
| 147 | } |
||
| 148 | }, |
||
| 149 | "first_name_lookup": { |
||
| 150 | "annotator_type": "docdeid.process.MultiTokenLookupAnnotator", |
||
| 151 | "group": "names", |
||
| 152 | "args": { |
||
| 153 | "tag": "voornaam", |
||
| 154 | "overlapping": true, |
||
| 155 | "lookup_values": "first_name" |
||
| 156 | } |
||
| 157 | }, |
||
| 158 | "surname_lookup": { |
||
| 159 | "annotator_type": "docdeid.process.MultiTokenLookupAnnotator", |
||
| 160 | "group": "names", |
||
| 161 | "args": { |
||
| 162 | "tag": "achternaam", |
||
| 163 | "overlapping": true, |
||
| 164 | "lookup_values": "surname" |
||
| 165 | } |
||
| 166 | }, |
||
| 167 | "patient_name": { |
||
| 168 | "annotator_type": "deduce.annotator.PatientNameAnnotator", |
||
| 169 | "group": "names", |
||
| 170 | "args": { |
||
| 171 | "tag": "_" |
||
| 172 | } |
||
| 173 | }, |
||
| 174 | "name_context": { |
||
| 175 | "annotator_type": "deduce.annotator.ContextAnnotator", |
||
| 176 | "group": "names", |
||
| 177 | "args": { |
||
| 178 | "iterative": true, |
||
| 179 | "pattern": [ |
||
| 180 | { |
||
| 181 | "name": "interfix_right", |
||
| 182 | "direction": "right", |
||
| 183 | "pre_tag": [ |
||
| 184 | "initiaal", |
||
| 185 | "naam", |
||
| 186 | "voornaam", |
||
| 187 | "achternaam", |
||
| 188 | "voornaam_patient", |
||
| 189 | "achternaam_patient" |
||
| 190 | ], |
||
| 191 | "tag": "{tag}+interfix+achternaam", |
||
| 192 | "skip": [".", "-"], |
||
| 193 | "pattern": [ |
||
| 194 | { |
||
| 195 | "lookup": "interfix" |
||
| 196 | }, |
||
| 197 | { |
||
| 198 | "like_name": true |
||
| 199 | } |
||
| 200 | ] |
||
| 201 | }, |
||
| 202 | { |
||
| 203 | "name": "initial_left", |
||
| 204 | "direction": "left", |
||
| 205 | "pre_tag": [ |
||
| 206 | "initiaal", |
||
| 207 | "naam", |
||
| 208 | "voornaam", |
||
| 209 | "achternaam", |
||
| 210 | "voornaam_patient", |
||
| 211 | "achternaam_patient", |
||
| 212 | "interfix" |
||
| 213 | ], |
||
| 214 | "tag": "initiaal+{tag}", |
||
| 215 | "skip": ["."], |
||
| 216 | "pattern": [ |
||
| 217 | { |
||
| 218 | "lookup": "initial" |
||
| 219 | } |
||
| 220 | ] |
||
| 221 | }, |
||
| 222 | { |
||
| 223 | "name": "naam_left", |
||
| 224 | "direction": "left", |
||
| 225 | "pre_tag": [ |
||
| 226 | "naam", |
||
| 227 | "voornaam", |
||
| 228 | "achternaam", |
||
| 229 | "voornaam_patient", |
||
| 230 | "achternaam_patient" |
||
| 231 | ], |
||
| 232 | "tag": "naam+{tag}", |
||
| 233 | "skip": ["-"], |
||
| 234 | "pattern": [ |
||
| 235 | { |
||
| 236 | "and": [ |
||
| 237 | { |
||
| 238 | "like_name": true |
||
| 239 | }, |
||
| 240 | { |
||
| 241 | "neg_lookup": "whitelist" |
||
| 242 | }, |
||
| 243 | { |
||
| 244 | "neg_lookup": "prefix" |
||
| 245 | } |
||
| 246 | ] |
||
| 247 | } |
||
| 248 | ] |
||
| 249 | }, |
||
| 250 | { |
||
| 251 | "name": "naam_right", |
||
| 252 | "direction": "right", |
||
| 253 | "pre_tag": [ |
||
| 254 | "prefix", |
||
| 255 | "initiaal", |
||
| 256 | "naam", |
||
| 257 | "voornaam", |
||
| 258 | "achternaam", |
||
| 259 | "voornaam_patient", |
||
| 260 | "achternaam_patient", |
||
| 261 | "interfix" |
||
| 262 | ], |
||
| 263 | "tag": "{tag}+naam", |
||
| 264 | "skip": ["-"], |
||
| 265 | "pattern": [ |
||
| 266 | { |
||
| 267 | "and": [ |
||
| 268 | { |
||
| 269 | "like_name": true |
||
| 270 | }, |
||
| 271 | { |
||
| 272 | "neg_lookup": "whitelist" |
||
| 273 | }, |
||
| 274 | { |
||
| 275 | "neg_lookup": "prefix" |
||
| 276 | } |
||
| 277 | ] |
||
| 278 | } |
||
| 279 | ] |
||
| 280 | }, |
||
| 281 | { |
||
| 282 | "name": "prefix_left", |
||
| 283 | "direction": "left", |
||
| 284 | "pre_tag": [ |
||
| 285 | "prefix", |
||
| 286 | "initiaal", |
||
| 287 | "naam", |
||
| 288 | "voornaam", |
||
| 289 | "achternaam", |
||
| 290 | "voornaam_patient", |
||
| 291 | "achternaam_patient", |
||
| 292 | "interfix" |
||
| 293 | ], |
||
| 294 | "tag": "prefix+{tag}", |
||
| 295 | "skip": ["."], |
||
| 296 | "pattern": [ |
||
| 297 | { |
||
| 298 | "and": [ |
||
| 299 | { |
||
| 300 | "lookup": "prefix" |
||
| 301 | } |
||
| 302 | ] |
||
| 303 | } |
||
| 304 | ] |
||
| 305 | } |
||
| 306 | ] |
||
| 307 | } |
||
| 308 | }, |
||
| 309 | "eponymous_disease": { |
||
| 310 | "annotator_type": "docdeid.process.MultiTokenLookupAnnotator", |
||
| 311 | "group": "names", |
||
| 312 | "args": { |
||
| 313 | "lookup_values": "eponymous_disease", |
||
| 314 | "tag": "pseudo_name", |
||
| 315 | "overlapping": true |
||
| 316 | } |
||
| 317 | }, |
||
| 318 | "placename": { |
||
| 319 | "annotator_type": "docdeid.process.MultiTokenLookupAnnotator", |
||
| 320 | "group": "locations", |
||
| 321 | "args": { |
||
| 322 | "lookup_values": "placename", |
||
| 323 | "overlapping": true, |
||
| 324 | "tag": "locatie" |
||
| 325 | } |
||
| 326 | }, |
||
| 327 | "street_pattern": { |
||
| 328 | "annotator_type": "deduce.annotator.TokenPatternAnnotator", |
||
| 329 | "group": "locations", |
||
| 330 | "args": { |
||
| 331 | "pattern": [ |
||
| 332 | { |
||
| 333 | "re_match": "[A-Z][a-z]+(baan|bolwerk|dam|dijk|dreef|drf|dyk|gr|gracht|hf|hof|kade|laan|ln|markt|mrkt|pad|park|pd|plantsoen|plein|pln|plnts|prk|singel|sngl|st|steeg|stg|str|straat|weg|wg)$" |
||
| 334 | } |
||
| 335 | ], |
||
| 336 | "tag": "straat", |
||
| 337 | "priority": 1 |
||
| 338 | } |
||
| 339 | }, |
||
| 340 | "street_lookup": { |
||
| 341 | "annotator_type": "docdeid.process.MultiTokenLookupAnnotator", |
||
| 342 | "group": "locations", |
||
| 343 | "args": { |
||
| 344 | "lookup_values": "street", |
||
| 345 | "overlapping": true, |
||
| 346 | "tag": "straat", |
||
| 347 | "priority": 1 |
||
| 348 | } |
||
| 349 | }, |
||
| 350 | "housenumber": { |
||
| 351 | "annotator_type": "deduce.annotator.ContextAnnotator", |
||
| 352 | "group": "locations", |
||
| 353 | "args": { |
||
| 354 | "iterative": true, |
||
| 355 | "pattern": [ |
||
| 356 | { |
||
| 357 | "name": "housenumber_right", |
||
| 358 | "direction": "right", |
||
| 359 | "pre_tag": [ |
||
| 360 | "straat" |
||
| 361 | ], |
||
| 362 | "tag": "{tag}+huisnummer", |
||
| 363 | "skip": [], |
||
| 364 | "pattern": [ |
||
| 365 | { |
||
| 366 | "re_match": "\\d{1,4}$" |
||
| 367 | } |
||
| 368 | ] |
||
| 369 | }, |
||
| 370 | { |
||
| 371 | "name": "housenumber_housenumberletter_right", |
||
| 372 | "direction": "right", |
||
| 373 | "pre_tag": [ |
||
| 374 | "straat" |
||
| 375 | ], |
||
| 376 | "tag": "{tag}+huisnummer+huisnummerletter", |
||
| 377 | "skip": [], |
||
| 378 | "pattern": [ |
||
| 379 | { |
||
| 380 | "re_match": "\\d{1,4}[a-zA-Z]$" |
||
| 381 | } |
||
| 382 | ] |
||
| 383 | }, |
||
| 384 | { |
||
| 385 | "name": "housenumberletter_right", |
||
| 386 | "direction": "right", |
||
| 387 | "pre_tag": [ |
||
| 388 | "huisnummer" |
||
| 389 | ], |
||
| 390 | "tag": "{tag}+huisnummerletter", |
||
| 391 | "skip": [], |
||
| 392 | "pattern": [ |
||
| 393 | { |
||
| 394 | "re_match": "[a-zA-Z]$" |
||
| 395 | } |
||
| 396 | ] |
||
| 397 | } |
||
| 398 | ] |
||
| 399 | } |
||
| 400 | }, |
||
| 401 | "postal_code": { |
||
| 402 | "annotator_type": "docdeid.process.RegexpAnnotator", |
||
| 403 | "group": "locations", |
||
| 404 | "args": { |
||
| 405 | "regexp_pattern": "(\\d{4}([A-Za-z]{2}| [A-Z]{2}))(?<!mg|MG|gr|ie)(\\W|$)", |
||
| 406 | "capturing_group": 1, |
||
| 407 | "tag": "locatie" |
||
| 408 | } |
||
| 409 | }, |
||
| 410 | "postbus": { |
||
| 411 | "annotator_type": "docdeid.process.RegexpAnnotator", |
||
| 412 | "group": "locations", |
||
| 413 | "args": { |
||
| 414 | "regexp_pattern": "([Pp]ostbus\\s\\d{1,5}(\\.\\d{2,4})?)", |
||
| 415 | "tag": "locatie", |
||
| 416 | "pre_match_words": ["postbus"] |
||
| 417 | } |
||
| 418 | }, |
||
| 419 | "hospital": { |
||
| 420 | "annotator_type": "docdeid.process.MultiTokenLookupAnnotator", |
||
| 421 | "group": "institutions", |
||
| 422 | "args": { |
||
| 423 | "lookup_values": "hospital", |
||
| 424 | "overlapping": true, |
||
| 425 | "tag": "ziekenhuis" |
||
| 426 | } |
||
| 427 | }, |
||
| 428 | "institution": { |
||
| 429 | "annotator_type": "docdeid.process.MultiTokenLookupAnnotator", |
||
| 430 | "group": "institutions", |
||
| 431 | "args": { |
||
| 432 | "lookup_values": "healthcare_institution", |
||
| 433 | "overlapping": true, |
||
| 434 | "tag": "zorginstelling" |
||
| 435 | } |
||
| 436 | }, |
||
| 437 | "date_dmy_1": { |
||
| 438 | "annotator_type": "docdeid.process.RegexpAnnotator", |
||
| 439 | "group": "dates", |
||
| 440 | "args": { |
||
| 441 | "regexp_pattern": "(?<!\\d)(([1-9]|0[1-9]|[12][0-9]|3[01])(?P<sep>[-/\\. ])([1-9]|0[1-9]|1[012])(?P=sep)((19|20|\\'|`)?\\d{2}))(?!\\d)", |
||
| 442 | "tag": "datum", |
||
| 443 | "capturing_group": 1 |
||
| 444 | } |
||
| 445 | }, |
||
| 446 | "date_dmy_2": { |
||
| 447 | "annotator_type": "docdeid.process.RegexpAnnotator", |
||
| 448 | "group": "dates", |
||
| 449 | "args": { |
||
| 450 | "regexp_pattern": "(?i)(?<!\\d)(([1-9]|0[1-9]|[12][0-9]|3[01])[-/\\. ]{,2}(januari|jan|februari|feb|maart|mrt|april|apr|mei|juni|jun|juli|jul|augustus|aug|september|sep|sept|oktober|okt|november|nov|december|dec)[-/\\. ]((19|20|\\'|`)?\\d{2}))(?!\\d)", |
||
| 451 | "tag": "datum", |
||
| 452 | "capturing_group": 1, |
||
| 453 | "pre_match_words": ["januari", "jan", "februari", "feb", "maart", "mrt", "april", "apr", "mei", "juni", "jun", "juli", "jul", "augustus", "aug", "september", "sep", "sept", "oktober", "okt", "november", "nov", "december", "dec"] |
||
| 454 | } |
||
| 455 | }, |
||
| 456 | "date_ymd_1": { |
||
| 457 | "annotator_type": "docdeid.process.RegexpAnnotator", |
||
| 458 | "group": "dates", |
||
| 459 | "args": { |
||
| 460 | "regexp_pattern": "(?<!\\d)(((19|20|\\'|`)\\d{2})(?P<sep>[-/\\. ])([1-9]|0[1-9]|1[012])(?P=sep)([1-9]|0[1-9]|[12][0-9]|3[01]))(\\D|$)", |
||
| 461 | "tag": "datum", |
||
| 462 | "capturing_group": 1 |
||
| 463 | } |
||
| 464 | }, |
||
| 465 | "date_ymd_2": { |
||
| 466 | "annotator_type": "docdeid.process.RegexpAnnotator", |
||
| 467 | "group": "dates", |
||
| 468 | "args": { |
||
| 469 | "regexp_pattern": "(?i)(?<!\\d)(((19|20|\\'|`)\\d{2})[-/\\. ]{,2}(januari|jan|februari|feb|maart|mrt|april|apr|mei|juni|jun|juli|jul|augustus|aug|september|sep|sept|oktober|okt|november|nov|december|dec)[-/\\. ]([1-9]|0[1-9]|[12][0-9]|3[01]))(?!\\d)", |
||
| 470 | "tag": "datum", |
||
| 471 | "capturing_group": 1, |
||
| 472 | "pre_match_words": ["januari", "jan", "februari", "feb", "maart", "mrt", "april", "apr", "mei", "juni", "jun", "juli", "jul", "augustus", "aug", "september", "sep", "sept", "oktober", "okt", "november", "nov", "december", "dec"] |
||
| 473 | } |
||
| 474 | }, |
||
| 475 | "age": { |
||
| 476 | "annotator_type": "deduce.annotator.RegexpPseudoAnnotator", |
||
| 477 | "group": "ages", |
||
| 478 | "args": { |
||
| 479 | "regexp_pattern": "(?i)(?<![\\d,\\.])((1?\\d?\\d)([\\.,]5)?(-(1?\\d?\\d)([\\.,]5)?)?)([ -](jaar|jarig|jarige|jr))(?!\\w)", |
||
| 480 | "pre_pseudo": ["<", "al", "co", "controle", "de", "elke", "gedurende", "na", "nog", "ongeveer", "over", "policontrole", "sinds", "up", "vanaf"], |
||
| 481 | "post_pseudo": ["aanwezig", "gebruikt", "geleden", "gerookt", "gestaakt", "gestopt", "getrouwd", "na", "naar", "nadien"], |
||
| 482 | "pre_match_words": ["jaar", "jarig", "jarige", "jr"], |
||
| 483 | "tag": "leeftijd", |
||
| 484 | "capturing_group": 1 |
||
| 485 | } |
||
| 486 | }, |
||
| 487 | "bsn": { |
||
| 488 | "annotator_type": "deduce.annotator.BsnAnnotator", |
||
| 489 | "group": "identifiers", |
||
| 490 | "args": { |
||
| 491 | "bsn_regexp": "(?<!\\d)(\\d{9})(?!\\d)", |
||
| 492 | "capture_group": 1, |
||
| 493 | "priority": 100, |
||
| 494 | "tag": "bsn" |
||
| 495 | } |
||
| 496 | }, |
||
| 497 | "identifier": { |
||
| 498 | "annotator_type": "docdeid.process.RegexpAnnotator", |
||
| 499 | "group": "identifiers", |
||
| 500 | "args": { |
||
| 501 | "regexp_pattern": "\\d{7,}", |
||
| 502 | "tag": "id" |
||
| 503 | } |
||
| 504 | }, |
||
| 505 | "phone": { |
||
| 506 | "annotator_type": "deduce.annotator.PhoneNumberAnnotator", |
||
| 507 | "group": "phone_numbers", |
||
| 508 | "args": { |
||
| 509 | "phone_regexp": "(?<!\\d)(\\(?(0031|\\+31|0)(1[035]|2[0347]|3[03568]|4[03456]|5[0358]|6|7|88|800|91|90[069]|[1-5]\\d{2})\\)?) ?-? ?((\\d{2,4}[ -]?)+\\d{2,4})", |
||
| 510 | "min_digits": 9, |
||
| 511 | "max_digits": 11, |
||
| 512 | "tag": "telefoonnummer" |
||
| 513 | } |
||
| 514 | }, |
||
| 515 | "email": { |
||
| 516 | "annotator_type": "docdeid.process.RegexpAnnotator", |
||
| 517 | "group": "email_addresses", |
||
| 518 | "args": { |
||
| 519 | "regexp_pattern": "(([-a-zA-Z0-9:%._\\+~#=]{1,256})@([-a-zA-Z0-9:%._\\+~#=]{1,256})(\\.)(com|net|org|co|us|uk|nl|be|fr|sp|gov|nu))", |
||
| 520 | "tag": "emailadres", |
||
| 521 | "pre_match_words": ["com", "net", "org", "co", "us", "uk", "nl", "be", "fr", "sp", "gov", "nu"] |
||
| 522 | } |
||
| 523 | }, |
||
| 524 | "url": { |
||
| 525 | "annotator_type": "docdeid.process.RegexpAnnotator", |
||
| 526 | "group": "urls", |
||
| 527 | "args": { |
||
| 528 | "regexp_pattern": "((https?:\\/\\/(?:www\\.)?)?([-a-zA-Z0-9:%._\\+~#=]{1,256})(\\.)(com|net|org|co|us|uk|nl|be|fr|sp|gov|nu)(\\b)([():%_\\+.~,]*[-a-zA-Z-0-9#?&/=]+)*)", |
||
| 529 | "tag": "url", |
||
| 530 | "pre_match_words": ["com", "net", "org", "co", "us", "uk", "nl", "be", "fr", "sp", "gov", "nu"] |
||
| 531 | } |
||
| 532 | } |
||
| 533 | } |
||
| 534 | } |