--- a +++ b/inst/extdata/predictions-GSE34171-hgu133plus2.txt @@ -0,0 +1,91 @@ +Sample PredictedClass Conf_TypeIII Conf_ABC Conf_GCB +GSM844286.CEL TypeIII 0.894 0.012 0.094 +GSM844292.CEL GCB 0.087 0.004 0.909 +GSM844290.CEL GCB 0.019 0.311 0.671 +GSM844323.CEL TypeIII 0.811 0.175 0.014 +GSM844297.CEL TypeIII 0.887 0.102 0.01 +GSM844288.CEL GCB 0.11 0.032 0.858 +GSM844294.CEL GCB 0.369 0.081 0.55 +GSM844303.CEL GCB 0.299 0.081 0.62 +GSM844304.CEL GCB 0.175 0.016 0.809 +GSM844287.CEL GCB 0.04 0.247 0.713 +GSM844302.CEL GCB 0.093 0.005 0.902 +GSM844301.CEL GCB 0.098 0.013 0.889 +GSM844300.CEL ABC 0.031 0.731 0.238 +GSM844282.CEL TypeIII 0.716 0.196 0.088 +GSM844295.CEL GCB 0.159 0.005 0.836 +GSM844281.CEL TypeIII 0.774 0.216 0.01 +GSM844308.CEL GCB 0.133 0 0.866 +GSM844244.CEL ABC 0.478 0.508 0.014 +GSM844299.CEL GCB 0.006 0.236 0.758 +GSM844291.CEL GCB 0.13 0.005 0.865 +GSM844305.CEL GCB 0.167 0.003 0.83 +GSM844296.CEL GCB 0.014 0.166 0.82 +GSM844284.CEL TypeIII 0.814 0.149 0.037 +GSM844293.CEL GCB 0.102 0.028 0.87 +GSM844285.CEL GCB 0.451 0.034 0.514 +GSM844298.CEL ABC 0.107 0.893 0 +GSM844283.CEL ABC 0.095 0.522 0.383 +GSM844289.CEL GCB 0.325 0.022 0.653 +GSM844306.CEL ABC 0.22 0.777 0.004 +GSM844311.CEL TypeIII 0.744 0.245 0.011 +GSM844242.CEL ABC 0.322 0.595 0.082 +GSM844243.CEL GCB 0.046 0.254 0.7 +GSM844317.CEL ABC 0.097 0.898 0.005 +GSM844310.CEL ABC 0.311 0.609 0.08 +GSM844331.CEL GCB 0.086 0.006 0.908 +GSM844325.CEL GCB 0.058 0.206 0.736 +GSM844307.CEL ABC 0.133 0.849 0.018 +GSM844330.CEL GCB 0.166 0.026 0.808 +GSM844318.CEL ABC 0.185 0.81 0.005 +GSM844329.CEL GCB 0.153 0.074 0.773 +GSM844328.CEL GCB 0.086 0.004 0.911 +GSM844245.CEL ABC 0.386 0.516 0.098 +GSM844246.CEL GCB 0.086 0.003 0.911 +GSM844314.CEL GCB 0.049 0.135 0.816 +GSM844247.CEL GCB 0.142 0.018 0.84 +GSM844326.CEL ABC 0.103 0.897 0 +GSM844321.CEL GCB 0.053 0.211 0.735 +GSM844248.CEL GCB 0.102 0.008 0.89 +GSM844249.CEL GCB 0.086 0.003 0.911 +GSM844316.CEL GCB 0.123 0 0.877 +GSM844250.CEL GCB 0.106 0.014 0.879 +GSM844251.CEL ABC 0.338 0.368 0.295 +GSM844313.CEL GCB 0.129 0.012 0.86 +GSM844252.CEL GCB 0.334 0.059 0.607 +GSM844253.CEL ABC 0.259 0.656 0.085 +GSM844254.CEL GCB 0.086 0.003 0.911 +GSM844255.CEL TypeIII 0.571 0.393 0.036 +GSM844319.CEL ABC 0.157 0.839 0.005 +GSM844256.CEL ABC 0.21 0.747 0.043 +GSM844315.CEL GCB 0.084 0.003 0.913 +GSM844257.CEL TypeIII 0.491 0.059 0.45 +GSM844322.CEL TypeIII 0.545 0.09 0.366 +GSM844324.CEL ABC 0.104 0.86 0.036 +GSM844258.CEL ABC 0.372 0.586 0.042 +GSM844270.CEL TypeIII 0.482 0.434 0.084 +GSM844259.CEL GCB 0.007 0.134 0.859 +GSM844309.CEL ABC 0.31 0.35 0.34 +GSM844320.CEL ABC 0.09 0.907 0.003 +GSM844260.CEL TypeIII 0.707 0.198 0.095 +GSM844261.CEL GCB 0.083 0.003 0.914 +GSM844262.CEL GCB 0.28 0.064 0.656 +GSM844263.CEL TypeIII 0.689 0.198 0.113 +GSM844264.CEL GCB 0.153 0.004 0.843 +GSM844265.CEL GCB 0.011 0.116 0.873 +GSM844266.CEL GCB 0.056 0.235 0.709 +GSM844267.CEL GCB 0.012 0.116 0.872 +GSM844268.CEL GCB 0.103 0.008 0.889 +GSM844269.CEL TypeIII 0.812 0.15 0.038 +GSM844271.CEL GCB 0.029 0.362 0.609 +GSM844272.CEL TypeIII 0.727 0.071 0.202 +GSM844327.CEL GCB 0.054 0.292 0.654 +GSM844312.CEL GCB 0.15 0.049 0.801 +GSM844273.CEL ABC 0.315 0.596 0.089 +GSM844274.CEL ABC 0.042 0.484 0.473 +GSM844332.CEL GCB 0.051 0.32 0.629 +GSM844276.CEL GCB 0.187 0.056 0.757 +GSM844277.CEL GCB 0.086 0.003 0.911 +GSM844278.CEL GCB 0.021 0.136 0.844 +GSM844279.CEL GCB 0.141 0.234 0.625 +GSM844280.CEL ABC 0.104 0.846 0.05