Switch to unified view

a b/inst/extdata/predictions-GSE19246.txt
1
Sample  PredictedClass  Conf_TypeIII    Conf_ABC    Conf_GCB
2
GSM476896.CEL   GCB 0.039   0.309   0.652
3
GSM476897.CEL   TypeIII 0.469   0.209   0.322
4
GSM476898.CEL   GCB 0.028   0.153   0.819
5
GSM476899.CEL   GCB 0.097   0.013   0.89
6
GSM476900.CEL   GCB 0.109   0.04    0.85
7
GSM476901.CEL   GCB 0.139   0.045   0.817
8
GSM476902.CEL   GCB 0.019   0.134   0.847
9
GSM476903.CEL   ABC 0.14    0.524   0.336
10
GSM476904.CEL   TypeIII 0.759   0.049   0.192
11
GSM476905.CEL   TypeIII 0.702   0.096   0.202
12
GSM476906.CEL   GCB 0.279   0.316   0.405
13
GSM476907.CEL   GCB 0.067   0.344   0.589
14
GSM476908.CEL   GCB 0.049   0.323   0.628
15
GSM476909.CEL   GCB 0.088   0.032   0.88
16
GSM476910.CEL   GCB 0.032   0.204   0.764
17
GSM476911.CEL   GCB 0.297   0.13    0.574
18
GSM476912.CEL   GCB 0.137   0.048   0.815
19
GSM476913.CEL   GCB 0.276   0.106   0.618
20
GSM476914.CEL   GCB 0.007   0.094   0.899
21
GSM476915.CEL   ABC 0.175   0.772   0.053
22
GSM476916.CEL   GCB 0.293   0.195   0.512
23
GSM476917.CEL   GCB 0.141   0.041   0.818
24
GSM476918.CEL   GCB 0.087   0.031   0.882
25
GSM476919.CEL   GCB 0.086   0.008   0.907
26
GSM476920.CEL   GCB 0.086   0.011   0.903
27
GSM476921.CEL   GCB 0.088   0.006   0.906
28
GSM476922.CEL   GCB 0.091   0.008   0.901
29
GSM476923.CEL   GCB 0.12    0.07    0.81
30
GSM476924.CEL   ABC 0.233   0.414   0.353
31
GSM476925.CEL   GCB 0.086   0.032   0.882
32
GSM476926.CEL   GCB 0.099   0.006   0.894
33
GSM476927.CEL   GCB 0.089   0.013   0.898
34
GSM476928.CEL   ABC 0.177   0.81    0.013
35
GSM476929.CEL   ABC 0.231   0.717   0.052
36
GSM476930.CEL   GCB 0.077   0.341   0.582
37
GSM476931.CEL   GCB 0.048   0.458   0.494
38
GSM476932.CEL   GCB 0.319   0.306   0.375
39
GSM476933.CEL   GCB 0.119   0.03    0.851
40
GSM476934.CEL   ABC 0.154   0.786   0.06
41
GSM476935.CEL   TypeIII 0.554   0.088   0.358
42
GSM476936.CEL   GCB 0.044   0.345   0.611
43
GSM476937.CEL   GCB 0.01    0.111   0.878
44
GSM476938.CEL   GCB 0.118   0.008   0.875
45
GSM476939.CEL   GCB 0.086   0.008   0.906
46
GSM476940.CEL   GCB 0.391   0.028   0.581
47
GSM476941.CEL   ABC 0.172   0.786   0.042
48
GSM476942.CEL   GCB 0.224   0.388   0.389
49
GSM476943.CEL   TypeIII 0.731   0.062   0.207
50
GSM476944.CEL   GCB 0.005   0.107   0.889
51
GSM476945.CEL   GCB 0.146   0.049   0.805
52
GSM476946.CEL   GCB 0.369   0.245   0.386
53
GSM476947.CEL   ABC 0.169   0.505   0.326
54
GSM476948.CEL   GCB 0.023   0.092   0.885
55
GSM476949.CEL   ABC 0.269   0.603   0.128
56
GSM476950.CEL   TypeIII 0.746   0.148   0.106
57
GSM476951.CEL   ABC 0.187   0.509   0.304
58
GSM476952.CEL   GCB 0.088   0.006   0.906
59
GSM476953.CEL   GCB 0.238   0.299   0.463
60
GSM476954.CEL   GCB 0.086   0.003   0.911
61
GSM476955.CEL   ABC 0.219   0.763   0.018
62
GSM476956.CEL   ABC 0.404   0.536   0.06
63
GSM476957.CEL   TypeIII 0.821   0.149   0.03
64
GSM476958.CEL   GCB 0.211   0.256   0.533
65
GSM476959.CEL   ABC 0.187   0.802   0.012
66
GSM476960.CEL   TypeIII 0.646   0.097   0.257
67
GSM476961.CEL   GCB 0.004   0.092   0.904
68
GSM476962.CEL   GCB 0.092   0.03    0.878
69
GSM476963.CEL   ABC 0.276   0.607   0.117
70
GSM476964.CEL   GCB 0.253   0.174   0.573
71
GSM476965.CEL   GCB 0.341   0.026   0.632
72
GSM476966.CEL   GCB 0.043   0.315   0.642
73
GSM476967.CEL   ABC 0.452   0.478   0.07
74
GSM476968.CEL   ABC 0.471   0.511   0.018
75
GSM476969.CEL   GCB 0.117   0.005   0.878
76
GSM476970.CEL   GCB 0.238   0.007   0.754
77
GSM476971.CEL   TypeIII 0.586   0.144   0.269
78
GSM476972.CEL   GCB 0.094   0.015   0.891
79
GSM476973.CEL   GCB 0.168   0.017   0.814
80
GSM476974.CEL   GCB 0.161   0.156   0.683
81
GSM476975.CEL   GCB 0.299   0.041   0.66
82
GSM476976.CEL   ABC 0.193   0.735   0.072
83
GSM476977.CEL   GCB 0.093   0.021   0.886
84
GSM476978.CEL   GCB 0.11    0.01    0.88
85
GSM476979.CEL   ABC 0.103   0.877   0.02
86
GSM476980.CEL   ABC 0.209   0.672   0.119
87
GSM476981.CEL   ABC 0.229   0.726   0.045
88
GSM476982.CEL   ABC 0.133   0.791   0.077
89
GSM476983.CEL   GCB 0.136   0.094   0.769
90
GSM476984.CEL   GCB 0.16    0.037   0.803
91
GSM476985.CEL   GCB 0.113   0.277   0.611
92
GSM476986.CEL   GCB 0.09    0.035   0.875
93
GSM476987.CEL   GCB 0.008   0.096   0.896
94
GSM476988.CEL   TypeIII 0.576   0.068   0.356
95
GSM476989.CEL   ABC 0.054   0.574   0.372
96
GSM476990.CEL   ABC 0.116   0.855   0.029
97
GSM476991.CEL   GCB 0.164   0.045   0.791
98
GSM476992.CEL   GCB 0.348   0.038   0.614
99
GSM476993.CEL   ABC 0.166   0.831   0.003
100
GSM476994.CEL   GCB 0.065   0.254   0.681
101
GSM476995.CEL   GCB 0.117   0.04    0.843
102
GSM476996.CEL   ABC 0.226   0.481   0.293
103
GSM476997.CEL   GCB 0.429   0.105   0.466
104
GSM476998.CEL   GCB 0.091   0.009   0.899
105
GSM476999.CEL   ABC 0.162   0.832   0.006
106
GSM477000.CEL   GCB 0.316   0.024   0.66
107
GSM477001.CEL   GCB 0.102   0.014   0.884
108
GSM477002.CEL   GCB 0.205   0.342   0.453
109
GSM477003.CEL   TypeIII 0.593   0.329   0.078
110
GSM477004.CEL   ABC 0.097   0.903   0
111
GSM477005.CEL   ABC 0.124   0.833   0.043
112
GSM477006.CEL   GCB 0.003   0.103   0.894
113
GSM477007.CEL   GCB 0.093   0.006   0.901
114
GSM477008.CEL   GCB 0.093   0.006   0.901
115
GSM477009.CEL   TypeIII 0.75    0.219   0.031
116
GSM477010.CEL   GCB 0.201   0.019   0.78
117
GSM477011.CEL   ABC 0.101   0.899   0
118
GSM477012.CEL   TypeIII 0.812   0.077   0.112
119
GSM477013.CEL   ABC 0.277   0.689   0.034
120
GSM477014.CEL   GCB 0.167   0.235   0.597
121
GSM477015.CEL   ABC 0.412   0.492   0.096
122
GSM477016.CEL   TypeIII 0.8 0.073   0.126
123
GSM477017.CEL   ABC 0.215   0.723   0.062
124
GSM477018.CEL   GCB 0.092   0.014   0.893
125
GSM477019.CEL   TypeIII 0.803   0.175   0.022
126
GSM477020.CEL   GCB 0.124   0   0.876
127
GSM477021.CEL   TypeIII 0.854   0.044   0.102
128
GSM477022.CEL   ABC 0.103   0.647   0.25
129
GSM477023.CEL   TypeIII 0.738   0.141   0.121
130
GSM477024.CEL   TypeIII 0.781   0.184   0.035
131
GSM477025.CEL   TypeIII 0.781   0.206   0.013
132
GSM477026.CEL   ABC 0.107   0.855   0.038
133
GSM477027.CEL   ABC 0.092   0.867   0.041
134
GSM477028.CEL   TypeIII 0.727   0.016   0.257
135
GSM477029.CEL   TypeIII 0.796   0.053   0.151
136
GSM477030.CEL   GCB 0.054   0.17    0.776
137
GSM477031.CEL   GCB 0.105   0.008   0.887
138
GSM477032.CEL   ABC 0.426   0.52    0.053
139
GSM477033.CEL   ABC 0.203   0.733   0.063
140
GSM477034.CEL   GCB 0.271   0.013   0.716
141
GSM477035.CEL   GCB 0.318   0.117   0.565
142
GSM477036.CEL   ABC 0.175   0.783   0.042
143
GSM477037.CEL   GCB 0.235   0.02    0.745
144
GSM477038.CEL   ABC 0.066   0.702   0.232
145
GSM477039.CEL   TypeIII 0.742   0.219   0.038
146
GSM477040.CEL   TypeIII 0.759   0.222   0.019
147
GSM477041.CEL   TypeIII 0.758   0.228   0.014
148
GSM477042.CEL   TypeIII 0.847   0.046   0.108
149
GSM477043.CEL   ABC 0.19    0.735   0.075
150
GSM477044.CEL   GCB 0.269   0.031   0.7
151
GSM477045.CEL   ABC 0.056   0.542   0.402
152
GSM477046.CEL   TypeIII 0.696   0.037   0.267
153
GSM477047.CEL   ABC 0.371   0.595   0.035
154
GSM477048.CEL   GCB 0.192   0.015   0.793
155
GSM477049.CEL   ABC 0.292   0.648   0.059
156
GSM477050.CEL   GCB 0.017   0.4 0.583
157
GSM477051.CEL   GCB 0.007   0.129   0.863
158
GSM477052.CEL   ABC 0.128   0.607   0.265
159
GSM477053.CEL   TypeIII 0.82    0.026   0.154
160
GSM477054.CEL   ABC 0.165   0.77    0.065
161
GSM477055.CEL   TypeIII 0.529   0.016   0.455
162
GSM477056.CEL   TypeIII 0.826   0.014   0.16
163
GSM477057.CEL   ABC 0.185   0.736   0.08
164
GSM477058.CEL   GCB 0.401   0.061   0.537
165
GSM477059.CEL   GCB 0.453   0.021   0.526
166
GSM477060.CEL   ABC 0.452   0.49    0.058
167
GSM477061.CEL   GCB 0.239   0.004   0.757
168
GSM477062.CEL   ABC 0.027   0.824   0.15
169
GSM477063.CEL   GCB 0.04    0.178   0.782
170
GSM477064.CEL   ABC 0.054   0.553   0.393
171
GSM477065.CEL   GCB 0.13    0.245   0.625
172
GSM477066.CEL   GCB 0.273   0.048   0.678
173
GSM477067.CEL   ABC 0.109   0.602   0.289
174
GSM477068.CEL   TypeIII 0.454   0.11    0.436
175
GSM477069.CEL   GCB 0.151   0.017   0.832
176
GSM477070.CEL   GCB 0.27    0.058   0.672
177
GSM477071.CEL   ABC 0.129   0.825   0.046
178
GSM477072.CEL   GCB 0.096   0.012   0.892