--- a +++ b/inst/extdata/predictions-GSE19246.txt @@ -0,0 +1,178 @@ +Sample PredictedClass Conf_TypeIII Conf_ABC Conf_GCB +GSM476896.CEL GCB 0.039 0.309 0.652 +GSM476897.CEL TypeIII 0.469 0.209 0.322 +GSM476898.CEL GCB 0.028 0.153 0.819 +GSM476899.CEL GCB 0.097 0.013 0.89 +GSM476900.CEL GCB 0.109 0.04 0.85 +GSM476901.CEL GCB 0.139 0.045 0.817 +GSM476902.CEL GCB 0.019 0.134 0.847 +GSM476903.CEL ABC 0.14 0.524 0.336 +GSM476904.CEL TypeIII 0.759 0.049 0.192 +GSM476905.CEL TypeIII 0.702 0.096 0.202 +GSM476906.CEL GCB 0.279 0.316 0.405 +GSM476907.CEL GCB 0.067 0.344 0.589 +GSM476908.CEL GCB 0.049 0.323 0.628 +GSM476909.CEL GCB 0.088 0.032 0.88 +GSM476910.CEL GCB 0.032 0.204 0.764 +GSM476911.CEL GCB 0.297 0.13 0.574 +GSM476912.CEL GCB 0.137 0.048 0.815 +GSM476913.CEL GCB 0.276 0.106 0.618 +GSM476914.CEL GCB 0.007 0.094 0.899 +GSM476915.CEL ABC 0.175 0.772 0.053 +GSM476916.CEL GCB 0.293 0.195 0.512 +GSM476917.CEL GCB 0.141 0.041 0.818 +GSM476918.CEL GCB 0.087 0.031 0.882 +GSM476919.CEL GCB 0.086 0.008 0.907 +GSM476920.CEL GCB 0.086 0.011 0.903 +GSM476921.CEL GCB 0.088 0.006 0.906 +GSM476922.CEL GCB 0.091 0.008 0.901 +GSM476923.CEL GCB 0.12 0.07 0.81 +GSM476924.CEL ABC 0.233 0.414 0.353 +GSM476925.CEL GCB 0.086 0.032 0.882 +GSM476926.CEL GCB 0.099 0.006 0.894 +GSM476927.CEL GCB 0.089 0.013 0.898 +GSM476928.CEL ABC 0.177 0.81 0.013 +GSM476929.CEL ABC 0.231 0.717 0.052 +GSM476930.CEL GCB 0.077 0.341 0.582 +GSM476931.CEL GCB 0.048 0.458 0.494 +GSM476932.CEL GCB 0.319 0.306 0.375 +GSM476933.CEL GCB 0.119 0.03 0.851 +GSM476934.CEL ABC 0.154 0.786 0.06 +GSM476935.CEL TypeIII 0.554 0.088 0.358 +GSM476936.CEL GCB 0.044 0.345 0.611 +GSM476937.CEL GCB 0.01 0.111 0.878 +GSM476938.CEL GCB 0.118 0.008 0.875 +GSM476939.CEL GCB 0.086 0.008 0.906 +GSM476940.CEL GCB 0.391 0.028 0.581 +GSM476941.CEL ABC 0.172 0.786 0.042 +GSM476942.CEL GCB 0.224 0.388 0.389 +GSM476943.CEL TypeIII 0.731 0.062 0.207 +GSM476944.CEL GCB 0.005 0.107 0.889 +GSM476945.CEL GCB 0.146 0.049 0.805 +GSM476946.CEL GCB 0.369 0.245 0.386 +GSM476947.CEL ABC 0.169 0.505 0.326 +GSM476948.CEL GCB 0.023 0.092 0.885 +GSM476949.CEL ABC 0.269 0.603 0.128 +GSM476950.CEL TypeIII 0.746 0.148 0.106 +GSM476951.CEL ABC 0.187 0.509 0.304 +GSM476952.CEL GCB 0.088 0.006 0.906 +GSM476953.CEL GCB 0.238 0.299 0.463 +GSM476954.CEL GCB 0.086 0.003 0.911 +GSM476955.CEL ABC 0.219 0.763 0.018 +GSM476956.CEL ABC 0.404 0.536 0.06 +GSM476957.CEL TypeIII 0.821 0.149 0.03 +GSM476958.CEL GCB 0.211 0.256 0.533 +GSM476959.CEL ABC 0.187 0.802 0.012 +GSM476960.CEL TypeIII 0.646 0.097 0.257 +GSM476961.CEL GCB 0.004 0.092 0.904 +GSM476962.CEL GCB 0.092 0.03 0.878 +GSM476963.CEL ABC 0.276 0.607 0.117 +GSM476964.CEL GCB 0.253 0.174 0.573 +GSM476965.CEL GCB 0.341 0.026 0.632 +GSM476966.CEL GCB 0.043 0.315 0.642 +GSM476967.CEL ABC 0.452 0.478 0.07 +GSM476968.CEL ABC 0.471 0.511 0.018 +GSM476969.CEL GCB 0.117 0.005 0.878 +GSM476970.CEL GCB 0.238 0.007 0.754 +GSM476971.CEL TypeIII 0.586 0.144 0.269 +GSM476972.CEL GCB 0.094 0.015 0.891 +GSM476973.CEL GCB 0.168 0.017 0.814 +GSM476974.CEL GCB 0.161 0.156 0.683 +GSM476975.CEL GCB 0.299 0.041 0.66 +GSM476976.CEL ABC 0.193 0.735 0.072 +GSM476977.CEL GCB 0.093 0.021 0.886 +GSM476978.CEL GCB 0.11 0.01 0.88 +GSM476979.CEL ABC 0.103 0.877 0.02 +GSM476980.CEL ABC 0.209 0.672 0.119 +GSM476981.CEL ABC 0.229 0.726 0.045 +GSM476982.CEL ABC 0.133 0.791 0.077 +GSM476983.CEL GCB 0.136 0.094 0.769 +GSM476984.CEL GCB 0.16 0.037 0.803 +GSM476985.CEL GCB 0.113 0.277 0.611 +GSM476986.CEL GCB 0.09 0.035 0.875 +GSM476987.CEL GCB 0.008 0.096 0.896 +GSM476988.CEL TypeIII 0.576 0.068 0.356 +GSM476989.CEL ABC 0.054 0.574 0.372 +GSM476990.CEL ABC 0.116 0.855 0.029 +GSM476991.CEL GCB 0.164 0.045 0.791 +GSM476992.CEL GCB 0.348 0.038 0.614 +GSM476993.CEL ABC 0.166 0.831 0.003 +GSM476994.CEL GCB 0.065 0.254 0.681 +GSM476995.CEL GCB 0.117 0.04 0.843 +GSM476996.CEL ABC 0.226 0.481 0.293 +GSM476997.CEL GCB 0.429 0.105 0.466 +GSM476998.CEL GCB 0.091 0.009 0.899 +GSM476999.CEL ABC 0.162 0.832 0.006 +GSM477000.CEL GCB 0.316 0.024 0.66 +GSM477001.CEL GCB 0.102 0.014 0.884 +GSM477002.CEL GCB 0.205 0.342 0.453 +GSM477003.CEL TypeIII 0.593 0.329 0.078 +GSM477004.CEL ABC 0.097 0.903 0 +GSM477005.CEL ABC 0.124 0.833 0.043 +GSM477006.CEL GCB 0.003 0.103 0.894 +GSM477007.CEL GCB 0.093 0.006 0.901 +GSM477008.CEL GCB 0.093 0.006 0.901 +GSM477009.CEL TypeIII 0.75 0.219 0.031 +GSM477010.CEL GCB 0.201 0.019 0.78 +GSM477011.CEL ABC 0.101 0.899 0 +GSM477012.CEL TypeIII 0.812 0.077 0.112 +GSM477013.CEL ABC 0.277 0.689 0.034 +GSM477014.CEL GCB 0.167 0.235 0.597 +GSM477015.CEL ABC 0.412 0.492 0.096 +GSM477016.CEL TypeIII 0.8 0.073 0.126 +GSM477017.CEL ABC 0.215 0.723 0.062 +GSM477018.CEL GCB 0.092 0.014 0.893 +GSM477019.CEL TypeIII 0.803 0.175 0.022 +GSM477020.CEL GCB 0.124 0 0.876 +GSM477021.CEL TypeIII 0.854 0.044 0.102 +GSM477022.CEL ABC 0.103 0.647 0.25 +GSM477023.CEL TypeIII 0.738 0.141 0.121 +GSM477024.CEL TypeIII 0.781 0.184 0.035 +GSM477025.CEL TypeIII 0.781 0.206 0.013 +GSM477026.CEL ABC 0.107 0.855 0.038 +GSM477027.CEL ABC 0.092 0.867 0.041 +GSM477028.CEL TypeIII 0.727 0.016 0.257 +GSM477029.CEL TypeIII 0.796 0.053 0.151 +GSM477030.CEL GCB 0.054 0.17 0.776 +GSM477031.CEL GCB 0.105 0.008 0.887 +GSM477032.CEL ABC 0.426 0.52 0.053 +GSM477033.CEL ABC 0.203 0.733 0.063 +GSM477034.CEL GCB 0.271 0.013 0.716 +GSM477035.CEL GCB 0.318 0.117 0.565 +GSM477036.CEL ABC 0.175 0.783 0.042 +GSM477037.CEL GCB 0.235 0.02 0.745 +GSM477038.CEL ABC 0.066 0.702 0.232 +GSM477039.CEL TypeIII 0.742 0.219 0.038 +GSM477040.CEL TypeIII 0.759 0.222 0.019 +GSM477041.CEL TypeIII 0.758 0.228 0.014 +GSM477042.CEL TypeIII 0.847 0.046 0.108 +GSM477043.CEL ABC 0.19 0.735 0.075 +GSM477044.CEL GCB 0.269 0.031 0.7 +GSM477045.CEL ABC 0.056 0.542 0.402 +GSM477046.CEL TypeIII 0.696 0.037 0.267 +GSM477047.CEL ABC 0.371 0.595 0.035 +GSM477048.CEL GCB 0.192 0.015 0.793 +GSM477049.CEL ABC 0.292 0.648 0.059 +GSM477050.CEL GCB 0.017 0.4 0.583 +GSM477051.CEL GCB 0.007 0.129 0.863 +GSM477052.CEL ABC 0.128 0.607 0.265 +GSM477053.CEL TypeIII 0.82 0.026 0.154 +GSM477054.CEL ABC 0.165 0.77 0.065 +GSM477055.CEL TypeIII 0.529 0.016 0.455 +GSM477056.CEL TypeIII 0.826 0.014 0.16 +GSM477057.CEL ABC 0.185 0.736 0.08 +GSM477058.CEL GCB 0.401 0.061 0.537 +GSM477059.CEL GCB 0.453 0.021 0.526 +GSM477060.CEL ABC 0.452 0.49 0.058 +GSM477061.CEL GCB 0.239 0.004 0.757 +GSM477062.CEL ABC 0.027 0.824 0.15 +GSM477063.CEL GCB 0.04 0.178 0.782 +GSM477064.CEL ABC 0.054 0.553 0.393 +GSM477065.CEL GCB 0.13 0.245 0.625 +GSM477066.CEL GCB 0.273 0.048 0.678 +GSM477067.CEL ABC 0.109 0.602 0.289 +GSM477068.CEL TypeIII 0.454 0.11 0.436 +GSM477069.CEL GCB 0.151 0.017 0.832 +GSM477070.CEL GCB 0.27 0.058 0.672 +GSM477071.CEL ABC 0.129 0.825 0.046 +GSM477072.CEL GCB 0.096 0.012 0.892