--- a +++ b/inst/extdata/predictions-GSE12195.txt @@ -0,0 +1,137 @@ +Sample PredictedClass Conf_TypeIII Conf_ABC Conf_GCB +GSM306875.CEL GCB 0.086 0.006 0.908 +GSM306876.CEL GCB 0.088 0.008 0.904 +GSM306877.CEL GCB 0.086 0.006 0.909 +GSM306878.CEL GCB 0.005 0.089 0.906 +GSM306879.CEL GCB 0.002 0.092 0.906 +GSM306880.CEL GCB 0.086 0.008 0.906 +GSM306881.CEL GCB 0.086 0.008 0.906 +GSM306882.CEL GCB 0.01 0.125 0.865 +GSM306883.CEL GCB 0.007 0.094 0.898 +GSM306884.CEL GCB 0.086 0.009 0.906 +GSM306886.CEL GCB 0.448 0.015 0.537 +GSM306887.CEL GCB 0.236 0.244 0.52 +GSM306888.CEL ABC 0.33 0.662 0.008 +GSM306889.CEL ABC 0.116 0.833 0.052 +GSM306890.CEL ABC 0.141 0.801 0.058 +GSM306891.CEL GCB 0.007 0.139 0.853 +GSM306892.CEL TypeIII 0.858 0.004 0.138 +GSM306893.CEL ABC 0.245 0.702 0.053 +GSM306894.CEL ABC 0.128 0.872 0 +GSM306895.CEL ABC 0.309 0.648 0.043 +GSM306896.CEL GCB 0.114 0 0.886 +GSM306897.CEL GCB 0.295 0.094 0.61 +GSM306898.CEL GCB 0.171 0 0.829 +GSM306899.CEL ABC 0.228 0.721 0.051 +GSM306900.CEL ABC 0.134 0.827 0.039 +GSM306902.CEL GCB 0.018 0.114 0.868 +GSM306903.CEL ABC 0.013 0.829 0.158 +GSM306904.CEL ABC 0.209 0.79 0 +GSM306905.CEL ABC 0.169 0.819 0.012 +GSM306906.CEL GCB 0.034 0.458 0.508 +GSM306907.CEL TypeIII 0.528 0.021 0.451 +GSM306908.CEL GCB 0.01 0.466 0.524 +GSM306909.CEL GCB 0.179 0.016 0.805 +GSM306910.CEL ABC 0.147 0.794 0.06 +GSM306911.CEL GCB 0.236 0.013 0.751 +GSM306912.CEL ABC 0.415 0.484 0.1 +GSM306913.CEL GCB 0.338 0.043 0.619 +GSM306914.CEL TypeIII 0.823 0.029 0.148 +GSM306915.CEL ABC 0.114 0.565 0.321 +GSM306916.CEL GCB 0.099 0.024 0.877 +GSM306918.CEL GCB 0.01 0.09 0.9 +GSM306919.CEL GCB 0.088 0.003 0.908 +GSM306920.CEL TypeIII 0.516 0.014 0.47 +GSM306921.CEL GCB 0.107 0.018 0.874 +GSM306922.CEL GCB 0.297 0.005 0.698 +GSM306923.CEL GCB 0.332 0.005 0.663 +GSM306924.CEL ABC 0.178 0.816 0.006 +GSM306925.CEL TypeIII 0.521 0.446 0.033 +GSM306926.CEL ABC 0.362 0.52 0.118 +GSM306927.CEL GCB 0.286 0.056 0.658 +GSM306928.CEL ABC 0.297 0.689 0.015 +GSM306930.CEL GCB 0.101 0.007 0.892 +GSM306931.CEL GCB 0.172 0 0.828 +GSM306932.CEL ABC 0.025 0.662 0.313 +GSM306933.CEL GCB 0.143 0.042 0.815 +GSM306934.CEL GCB 0.106 0.002 0.892 +GSM306935.CEL GCB 0.003 0.091 0.906 +GSM306936.CEL TypeIII 0.481 0.334 0.185 +GSM306937.CEL GCB 0.387 0.007 0.605 +GSM306938.CEL ABC 0.151 0.846 0.003 +GSM306939.CEL GCB 0.326 0.211 0.464 +GSM306940.CEL GCB 0.155 0.001 0.844 +GSM306944.CEL GCB 0.178 0 0.822 +GSM306946.CEL GCB 0.128 0.002 0.87 +GSM306947.CEL ABC 0.221 0.636 0.144 +GSM306948.CEL TypeIII 0.613 0.189 0.198 +GSM306949.CEL ABC 0.16 0.816 0.025 +GSM387565.CEL GCB 0.007 0.139 0.853 +GSM387566.CEL GCB 0.15 0.063 0.787 +GSM387567.CEL ABC 0.283 0.672 0.045 +GSM387568.CEL ABC 0.29 0.705 0.005 +GSM387569.CEL GCB 0.086 0.003 0.911 +GSM387570.CEL ABC 0.339 0.369 0.292 +GSM387571.CEL ABC 0.206 0.742 0.053 +GSM387572.CEL GCB 0.009 0.107 0.884 +GSM387573.CEL TypeIII 0.825 0.03 0.145 +GSM387574.CEL ABC 0.097 0.895 0.008 +GSM387575.CEL GCB 0.098 0.004 0.898 +GSM387576.CEL GCB 0.23 0.012 0.758 +GSM387577.CEL TypeIII 0.699 0.047 0.254 +GSM387578.CEL TypeIII 0.445 0.373 0.182 +GSM387579.CEL ABC 0.058 0.835 0.107 +GSM387580.CEL GCB 0.097 0.22 0.683 +GSM476258.CEL ABC 0.45 0.498 0.051 +GSM476259.CEL ABC 0.169 0.777 0.054 +GSM476260.CEL ABC 0.18 0.779 0.041 +GSM476261.CEL ABC 0.433 0.531 0.036 +GSM476262.CEL ABC 0.44 0.537 0.023 +GSM476263.CEL ABC 0.423 0.432 0.144 +GSM476264.CEL TypeIII 0.653 0.301 0.047 +GSM476265.CEL GCB 0.346 0.075 0.579 +GSM476266.CEL ABC 0.485 0.485 0.03 +GSM476267.CEL ABC 0.201 0.76 0.039 +GSM476268.CEL ABC 0.082 0.684 0.234 +GSM476269.CEL TypeIII 0.701 0.221 0.078 +GSM476270.CEL ABC 0.31 0.681 0.009 +GSM476271.CEL GCB 0.092 0.305 0.603 +GSM476272.CEL GCB 0.368 0.039 0.593 +GSM476273.CEL GCB 0.346 0.052 0.601 +GSM476274.CEL TypeIII 0.697 0.087 0.216 +GSM476275.CEL ABC 0.344 0.472 0.183 +GSM476276.CEL GCB 0.169 0.135 0.696 +GSM476277.CEL GCB 0.151 0.005 0.844 +GSM476278.CEL GCB 0.28 0.022 0.698 +GSM476279.CEL GCB 0.463 0.01 0.527 +GSM476280.CEL GCB 0.276 0.035 0.689 +GSM476281.CEL GCB 0.106 0.024 0.87 +GSM476282.CEL GCB 0.102 0.019 0.879 +GSM476283.CEL GCB 0.098 0.014 0.888 +GSM476284.CEL GCB 0.081 0.183 0.736 +GSM476285.CEL GCB 0.175 0.03 0.794 +GSM476286.CEL GCB 0.277 0.191 0.532 +GSM476287.CEL GCB 0.114 0.048 0.838 +GSM476288.CEL GCB 0.009 0.106 0.885 +GSM476289.CEL GCB 0.009 0.128 0.862 +GSM476290.CEL TypeIII 0.833 0.151 0.016 +GSM476291.CEL GCB 0.088 0.006 0.906 +GSM476292.CEL TypeIII 0.539 0.107 0.354 +GSM476293.CEL GCB 0.164 0.004 0.832 +GSM476294.CEL GCB 0.166 0.065 0.768 +GSM476295.CEL GCB 0.107 0.006 0.887 +GSM476296.CEL GCB 0.141 0 0.859 +GSM476297.CEL GCB 0.037 0.241 0.722 +GSM476298.CEL GCB 0.029 0.223 0.748 +GSM476299.CEL GCB 0.125 0.014 0.861 +GSM476300.CEL GCB 0.011 0.482 0.507 +GSM476301.CEL GCB 0.096 0.009 0.894 +GSM476302.CEL GCB 0.258 0.119 0.623 +GSM476303.CEL GCB 0.307 0.013 0.68 +GSM476304.CEL GCB 0.122 0.031 0.847 +GSM476305.CEL GCB 0.033 0.133 0.833 +GSM476306.CEL ABC 0.301 0.449 0.251 +GSM476307.CEL TypeIII 0.628 0.369 0.003 +GSM476308.CEL TypeIII 0.735 0.261 0.004 +GSM476309.CEL ABC 0.474 0.519 0.007 +GSM476310.CEL TypeIII 0.543 0.455 0.003