--- a
+++ b/inst/extdata/predictions-GSE10846-RCHOP.txt
@@ -0,0 +1,234 @@
+Sample	PredictedClass	Conf_TypeIII	Conf_ABC	Conf_GCB
+GSM275076.cel	ABC	0.111	0.877	0.012
+GSM275077.cel	GCB	0.104	0.042	0.854
+GSM275078.cel	GCB	0.121	0.002	0.876
+GSM275079.cel	GCB	0.015	0.256	0.729
+GSM275080.cel	ABC	0.131	0.869	0
+GSM275081.cel	TypeIII	0.58	0.041	0.379
+GSM275082.cel	TypeIII	0.75	0.009	0.241
+GSM275083.cel	GCB	0.178	0.014	0.808
+GSM275084.cel	GCB	0.086	0.006	0.909
+GSM275085.cel	GCB	0.029	0.179	0.791
+GSM275086.cel	TypeIII	0.68	0.294	0.026
+GSM275087.cel	GCB	0.088	0.004	0.909
+GSM275088.cel	ABC	0.182	0.774	0.044
+GSM275089.cel	GCB	0.088	0.003	0.909
+GSM275090.cel	ABC	0.355	0.53	0.115
+GSM275091.cel	ABC	0.249	0.671	0.079
+GSM275092.cel	GCB	0.087	0.003	0.911
+GSM275093.cel	TypeIII	0.508	0.385	0.106
+GSM275094.cel	GCB	0.138	0.03	0.832
+GSM275095.cel	GCB	0.177	0.019	0.803
+GSM275096.cel	GCB	0.094	0.007	0.9
+GSM275097.cel	ABC	0.046	0.498	0.456
+GSM275098.cel	GCB	0.029	0.323	0.648
+GSM275099.cel	GCB	0	0.087	0.913
+GSM275100.cel	ABC	0.169	0.789	0.042
+GSM275101.cel	ABC	0.025	0.644	0.33
+GSM275102.cel	GCB	0.22	0.271	0.509
+GSM275103.cel	GCB	0.088	0.006	0.906
+GSM275104.cel	GCB	0.092	0.003	0.905
+GSM275105.cel	TypeIII	0.884	0.03	0.086
+GSM275106.cel	GCB	0.086	0.003	0.911
+GSM275107.cel	GCB	0.086	0.006	0.908
+GSM275108.cel	GCB	0.088	0.008	0.904
+GSM275109.cel	ABC	0.227	0.67	0.102
+GSM275110.cel	TypeIII	0.88	0.024	0.096
+GSM275111.cel	TypeIII	0.46	0.119	0.421
+GSM275112.cel	ABC	0.223	0.764	0.013
+GSM275113.cel	GCB	0.105	0.007	0.888
+GSM275114.cel	GCB	0.145	0.007	0.848
+GSM275115.cel	ABC	0.423	0.565	0.011
+GSM275116.cel	ABC	0.34	0.636	0.024
+GSM275117.cel	GCB	0.093	0.031	0.876
+GSM275118.cel	GCB	0.094	0.004	0.902
+GSM275119.cel	ABC	0.102	0.836	0.062
+GSM275120.cel	GCB	0.039	0.331	0.63
+GSM275121.cel	ABC	0.397	0.523	0.08
+GSM275122.cel	ABC	0.25	0.734	0.017
+GSM275123.cel	ABC	0.117	0.852	0.031
+GSM275124.cel	GCB	0.054	0.464	0.483
+GSM275125.cel	ABC	0.12	0.868	0.012
+GSM275126.cel	GCB	0.086	0.006	0.907
+GSM275127.cel	GCB	0.104	0.003	0.893
+GSM275128.cel	ABC	0.15	0.593	0.257
+GSM275129.cel	GCB	0.114	0.004	0.882
+GSM275130.cel	ABC	0.107	0.893	0
+GSM275131.cel	GCB	0.342	0.095	0.563
+GSM275132.cel	ABC	0.14	0.858	0.002
+GSM275133.cel	GCB	0.087	0.01	0.902
+GSM275134.cel	GCB	0.101	0.003	0.896
+GSM275135.cel	ABC	0.124	0.876	0.001
+GSM275136.cel	ABC	0.223	0.72	0.057
+GSM275137.cel	GCB	0.115	0.373	0.512
+GSM275138.cel	GCB	0.169	0.024	0.806
+GSM275139.cel	ABC	0.292	0.665	0.043
+GSM275140.cel	ABC	0.047	0.749	0.205
+GSM275141.cel	ABC	0.028	0.753	0.219
+GSM275142.cel	ABC	0.065	0.811	0.123
+GSM275143.cel	ABC	0.028	0.854	0.117
+GSM275144.cel	GCB	0.007	0.239	0.755
+GSM275145.cel	GCB	0.069	0.378	0.553
+GSM275146.cel	GCB	0.179	0.016	0.805
+GSM275147.cel	GCB	0.124	0.094	0.782
+GSM275148.cel	GCB	0.122	0.003	0.875
+GSM275149.cel	GCB	0.407	0.026	0.567
+GSM275150.cel	GCB	0.011	0.149	0.84
+GSM275151.cel	ABC	0.151	0.785	0.064
+GSM275152.cel	ABC	0.444	0.468	0.088
+GSM275153.cel	GCB	0.096	0.053	0.851
+GSM275154.cel	GCB	0.118	0	0.882
+GSM275155.cel	ABC	0.107	0.883	0.01
+GSM275156.cel	GCB	0.097	0.004	0.899
+GSM275157.cel	GCB	0.177	0.046	0.777
+GSM275158.cel	GCB	0.095	0.017	0.888
+GSM275159.cel	TypeIII	0.544	0.419	0.037
+GSM275160.cel	ABC	0.175	0.752	0.073
+GSM275161.cel	ABC	0.132	0.808	0.06
+GSM275162.cel	TypeIII	0.434	0.343	0.223
+GSM275163.cel	GCB	0.242	0.085	0.673
+GSM275164.cel	GCB	0.09	0.006	0.904
+GSM275165.cel	ABC	0.302	0.654	0.044
+GSM275166.cel	GCB	0.088	0.028	0.884
+GSM275167.cel	GCB	0.199	0.034	0.767
+GSM275168.cel	ABC	0.24	0.645	0.115
+GSM275169.cel	TypeIII	0.839	0.141	0.02
+GSM275170.cel	TypeIII	0.513	0.051	0.435
+GSM275171.cel	TypeIII	0.547	0.076	0.377
+GSM275172.cel	ABC	0.219	0.737	0.044
+GSM275173.cel	TypeIII	0.872	0.11	0.018
+GSM275174.cel	ABC	0.073	0.73	0.197
+GSM275175.cel	GCB	0.098	0.028	0.874
+GSM275176.cel	TypeIII	0.596	0.064	0.34
+GSM275177.cel	TypeIII	0.72	0.212	0.068
+GSM275178.cel	GCB	0.101	0.006	0.893
+GSM275179.cel	ABC	0.11	0.89	0
+GSM275180.cel	GCB	0.091	0.039	0.869
+GSM275181.cel	TypeIII	0.781	0.207	0.012
+GSM275182.cel	GCB	0.057	0.191	0.752
+GSM275183.cel	TypeIII	0.88	0.105	0.014
+GSM275184.cel	GCB	0.104	0.01	0.886
+GSM275185.cel	ABC	0.352	0.633	0.015
+GSM275186.cel	GCB	0.278	0.035	0.687
+GSM275187.cel	GCB	0.113	0.021	0.866
+GSM275188.cel	TypeIII	0.461	0.44	0.099
+GSM275189.cel	ABC	0.451	0.531	0.018
+GSM275190.cel	GCB	0.244	0.019	0.737
+GSM275191.cel	GCB	0.04	0.419	0.541
+GSM275192.cel	TypeIII	0.831	0.154	0.015
+GSM275193.cel	GCB	0.118	0.003	0.878
+GSM275194.cel	GCB	0.011	0.098	0.892
+GSM275195.cel	ABC	0.421	0.499	0.08
+GSM275196.cel	ABC	0.435	0.555	0.011
+GSM275197.cel	GCB	0.118	0	0.882
+GSM275198.cel	TypeIII	0.84	0.152	0.008
+GSM275199.cel	ABC	0.068	0.784	0.147
+GSM275200.cel	TypeIII	0.875	0.022	0.103
+GSM275201.cel	GCB	0.088	0.003	0.908
+GSM275202.cel	TypeIII	0.77	0.068	0.162
+GSM275203.cel	ABC	0.165	0.829	0.005
+GSM275204.cel	TypeIII	0.797	0.012	0.191
+GSM275205.cel	GCB	0.038	0.297	0.665
+GSM275206.cel	ABC	0.107	0.893	0
+GSM275207.cel	ABC	0.181	0.807	0.012
+GSM275208.cel	GCB	0.418	0.028	0.555
+GSM275209.cel	GCB	0.148	0.086	0.766
+GSM275210.cel	TypeIII	0.855	0.135	0.01
+GSM275211.cel	GCB	0.091	0.003	0.906
+GSM275212.cel	GCB	0.088	0.011	0.901
+GSM275213.cel	GCB	0.007	0.119	0.874
+GSM275214.cel	GCB	0.185	0.016	0.8
+GSM275215.cel	TypeIII	0.84	0.01	0.149
+GSM275216.cel	ABC	0.119	0.876	0.005
+GSM275217.cel	ABC	0.133	0.82	0.048
+GSM275218.cel	GCB	0.086	0.003	0.91
+GSM275219.cel	GCB	0.013	0.133	0.853
+GSM275220.cel	GCB	0.161	0.004	0.835
+GSM275221.cel	ABC	0.055	0.775	0.17
+GSM275222.cel	GCB	0.005	0.095	0.9
+GSM275223.cel	TypeIII	0.903	0.005	0.092
+GSM275224.cel	TypeIII	0.771	0.03	0.199
+GSM275225.cel	TypeIII	0.585	0.104	0.311
+GSM275226.cel	ABC	0.027	0.52	0.452
+GSM275227.cel	GCB	0.005	0.089	0.906
+GSM275228.cel	GCB	0.36	0.002	0.638
+GSM275229.cel	ABC	0.15	0.774	0.076
+GSM275230.cel	GCB	0.088	0.006	0.906
+GSM275231.cel	TypeIII	0.531	0.048	0.421
+GSM275232.cel	GCB	0.088	0.005	0.907
+GSM275233.cel	GCB	0.094	0.011	0.895
+GSM275234.cel	GCB	0.086	0.004	0.911
+GSM275235.cel	ABC	0.189	0.526	0.286
+GSM275236.cel	ABC	0.168	0.775	0.057
+GSM275237.cel	ABC	0.396	0.562	0.042
+GSM275238.cel	ABC	0.205	0.709	0.087
+GSM275239.cel	GCB	0.005	0.137	0.858
+GSM275240.cel	GCB	0.009	0.25	0.741
+GSM275241.cel	ABC	0.129	0.865	0.006
+GSM275242.cel	ABC	0.095	0.903	0.003
+GSM275243.cel	GCB	0.005	0.102	0.893
+GSM275244.cel	TypeIII	0.883	0.017	0.1
+GSM275245.cel	TypeIII	0.526	0.396	0.077
+GSM275246.cel	GCB	0.414	0.113	0.473
+GSM275247.cel	TypeIII	0.58	0.393	0.027
+GSM275248.cel	GCB	0.127	0.04	0.833
+GSM275249.cel	ABC	0.158	0.432	0.411
+GSM275250.cel	GCB	0.092	0.004	0.904
+GSM275251.cel	GCB	0.097	0.023	0.88
+GSM275252.cel	ABC	0.082	0.753	0.165
+GSM275253.cel	GCB	0.012	0.225	0.763
+GSM275254.cel	TypeIII	0.831	0.028	0.141
+GSM275255.cel	GCB	0.32	0.022	0.658
+GSM275256.cel	ABC	0.151	0.835	0.014
+GSM275257.cel	GCB	0.168	0.106	0.727
+GSM275258.cel	GCB	0.171	0.041	0.788
+GSM275259.cel	GCB	0.176	0.001	0.823
+GSM275260.cel	GCB	0.426	0.017	0.557
+GSM275261.cel	ABC	0.093	0.48	0.427
+GSM275262.cel	TypeIII	0.476	0.433	0.091
+GSM275263.cel	GCB	0.116	0.035	0.849
+GSM275264.cel	TypeIII	0.552	0.009	0.439
+GSM275265.cel	TypeIII	0.823	0.141	0.036
+GSM275266.cel	GCB	0.16	0.039	0.8
+GSM275267.cel	ABC	0.076	0.779	0.145
+GSM275268.cel	ABC	0.073	0.551	0.376
+GSM275269.cel	ABC	0.289	0.623	0.088
+GSM275270.cel	GCB	0.133	0.029	0.838
+GSM275271.cel	ABC	0.208	0.61	0.182
+GSM275272.cel	ABC	0.152	0.798	0.05
+GSM275273.cel	GCB	0.086	0.003	0.911
+GSM275274.cel	TypeIII	0.829	0.153	0.018
+GSM275275.cel	ABC	0.127	0.869	0.003
+GSM275276.cel	GCB	0.009	0.119	0.872
+GSM275277.cel	TypeIII	0.477	0.411	0.112
+GSM275278.cel	TypeIII	0.771	0.225	0.003
+GSM275279.cel	ABC	0.015	0.844	0.14
+GSM275280.cel	GCB	0.074	0.274	0.652
+GSM275281.cel	GCB	0.103	0.011	0.885
+GSM275282.cel	GCB	0.098	0.016	0.887
+GSM275283.cel	GCB	0.005	0.089	0.906
+GSM275284.cel	GCB	0.091	0.003	0.905
+GSM275285.cel	GCB	0.008	0.098	0.894
+GSM275286.cel	ABC	0.005	0.572	0.422
+GSM275287.cel	GCB	0.172	0.032	0.797
+GSM275288.cel	GCB	0.09	0.004	0.907
+GSM275289.cel	TypeIII	0.53	0.347	0.123
+GSM275290.cel	ABC	0.374	0.604	0.023
+GSM275291.cel	ABC	0.177	0.819	0.003
+GSM275292.cel	GCB	0.101	0.004	0.895
+GSM275293.cel	ABC	0.045	0.808	0.147
+GSM275294.cel	GCB	0.338	0.131	0.532
+GSM275295.cel	GCB	0.09	0.006	0.904
+GSM275296.cel	GCB	0.086	0.003	0.911
+GSM275297.cel	ABC	0.095	0.902	0.003
+GSM275298.cel	GCB	0.109	0.01	0.88
+GSM275299.cel	GCB	0.008	0.14	0.852
+GSM275300.cel	ABC	0.182	0.811	0.008
+GSM275301.cel	TypeIII	0.857	0.034	0.109
+GSM275302.cel	GCB	0.153	0.032	0.815
+GSM275303.cel	GCB	0.135	0.007	0.857
+GSM275304.cel	TypeIII	0.823	0.133	0.044
+GSM275305.cel	ABC	0.191	0.777	0.032
+GSM275306.cel	GCB	0.086	0.003	0.911
+GSM275307.cel	ABC	0.022	0.742	0.236
+GSM275308.cel	GCB	0.1	0.006	0.894