--- a +++ b/inst/extdata/predictions-GSE10846-CHOP.txt @@ -0,0 +1,182 @@ +Sample PredictedClass Conf_TypeIII Conf_ABC Conf_GCB +GSM274895.cel GCB 0.148 0.015 0.837 +GSM274896.cel GCB 0.143 0 0.856 +GSM274897.cel ABC 0.128 0.872 0 +GSM274898.cel ABC 0.111 0.881 0.008 +GSM274899.cel ABC 0.071 0.809 0.12 +GSM274900.cel ABC 0.313 0.572 0.115 +GSM274901.cel ABC 0.481 0.508 0.012 +GSM274902.cel ABC 0.132 0.8 0.068 +GSM274903.cel GCB 0.086 0.003 0.911 +GSM274904.cel GCB 0.006 0.098 0.896 +GSM274905.cel GCB 0.072 0.186 0.742 +GSM274906.cel GCB 0.094 0.016 0.89 +GSM274907.cel GCB 0.116 0.002 0.882 +GSM274908.cel GCB 0.118 0.002 0.879 +GSM274909.cel GCB 0.086 0.004 0.91 +GSM274910.cel GCB 0.088 0.004 0.908 +GSM274911.cel GCB 0.098 0.008 0.894 +GSM274912.cel GCB 0.113 0 0.887 +GSM274913.cel GCB 0.47 0.014 0.516 +GSM274914.cel ABC 0.13 0.865 0.005 +GSM274915.cel ABC 0.282 0.605 0.112 +GSM274916.cel GCB 0.086 0.003 0.911 +GSM274917.cel ABC 0.273 0.706 0.021 +GSM274918.cel GCB 0.086 0.003 0.911 +GSM274919.cel ABC 0.111 0.886 0.003 +GSM274920.cel ABC 0.439 0.468 0.093 +GSM274921.cel ABC 0.142 0.857 0.001 +GSM274922.cel GCB 0.093 0.006 0.901 +GSM274923.cel TypeIII 0.502 0.442 0.057 +GSM274924.cel ABC 0.175 0.804 0.021 +GSM274925.cel GCB 0.007 0.137 0.857 +GSM274926.cel ABC 0.137 0.855 0.007 +GSM274927.cel GCB 0.315 0.045 0.64 +GSM274928.cel GCB 0.115 0 0.885 +GSM274929.cel GCB 0.092 0.074 0.834 +GSM274930.cel GCB 0.084 0.001 0.915 +GSM274931.cel GCB 0.121 0 0.879 +GSM274932.cel GCB 0.003 0.095 0.903 +GSM274933.cel ABC 0.229 0.758 0.014 +GSM274934.cel ABC 0.357 0.618 0.025 +GSM274935.cel TypeIII 0.685 0.039 0.276 +GSM274936.cel GCB 0.126 0 0.874 +GSM274937.cel GCB 0.086 0.003 0.911 +GSM274938.cel ABC 0.134 0.514 0.352 +GSM274939.cel GCB 0.15 0.018 0.832 +GSM274940.cel GCB 0.088 0.003 0.908 +GSM274941.cel ABC 0.391 0.536 0.072 +GSM274942.cel ABC 0.392 0.565 0.044 +GSM274943.cel GCB 0.005 0.092 0.903 +GSM274944.cel GCB 0.129 0.008 0.863 +GSM274945.cel ABC 0.151 0.803 0.046 +GSM274946.cel GCB 0.12 0.027 0.853 +GSM274947.cel GCB 0.086 0.003 0.911 +GSM274948.cel ABC 0.127 0.86 0.013 +GSM274949.cel GCB 0.086 0.006 0.908 +GSM274950.cel ABC 0.108 0.636 0.255 +GSM274951.cel GCB 0.146 0.011 0.843 +GSM274952.cel GCB 0.223 0.012 0.765 +GSM274953.cel GCB 0.194 0.399 0.407 +GSM274954.cel ABC 0.227 0.769 0.003 +GSM274955.cel TypeIII 0.6 0.006 0.394 +GSM274956.cel GCB 0.088 0.004 0.908 +GSM274957.cel ABC 0.227 0.766 0.007 +GSM274958.cel TypeIII 0.487 0.427 0.086 +GSM274959.cel TypeIII 0.887 0.018 0.095 +GSM274960.cel ABC 0.148 0.821 0.03 +GSM274961.cel GCB 0.005 0.102 0.893 +GSM274962.cel GCB 0.133 0.276 0.591 +GSM274963.cel GCB 0.192 0.018 0.79 +GSM274964.cel ABC 0.175 0.802 0.023 +GSM274965.cel GCB 0.084 0 0.916 +GSM274966.cel GCB 0.007 0.119 0.874 +GSM274967.cel GCB 0.02 0.48 0.5 +GSM274968.cel TypeIII 0.565 0.429 0.007 +GSM274969.cel GCB 0.094 0.004 0.903 +GSM274970.cel ABC 0.191 0.808 0 +GSM274971.cel GCB 0.123 0.009 0.869 +GSM274972.cel ABC 0.102 0.898 0 +GSM274973.cel GCB 0.369 0.022 0.61 +GSM274974.cel ABC 0.014 0.87 0.116 +GSM274975.cel ABC 0.151 0.848 0.001 +GSM274976.cel GCB 0.176 0.001 0.822 +GSM274977.cel GCB 0.1 0.003 0.897 +GSM274978.cel ABC 0.035 0.519 0.446 +GSM274979.cel ABC 0.152 0.796 0.052 +GSM274980.cel TypeIII 0.512 0.463 0.025 +GSM274981.cel ABC 0.101 0.888 0.01 +GSM274982.cel GCB 0.105 0.006 0.889 +GSM274983.cel ABC 0.162 0.794 0.044 +GSM274984.cel ABC 0.189 0.509 0.302 +GSM274985.cel TypeIII 0.738 0.163 0.099 +GSM274986.cel GCB 0.098 0.004 0.898 +GSM274987.cel GCB 0.091 0.006 0.903 +GSM274988.cel ABC 0.143 0.8 0.058 +GSM274989.cel GCB 0.135 0.239 0.626 +GSM274990.cel GCB 0.141 0.004 0.855 +GSM274991.cel GCB 0.153 0 0.847 +GSM274992.cel GCB 0.008 0.102 0.89 +GSM274993.cel GCB 0.103 0.02 0.878 +GSM274994.cel GCB 0.09 0.009 0.9 +GSM274995.cel ABC 0.141 0.858 0.001 +GSM274996.cel ABC 0.171 0.824 0.005 +GSM274997.cel TypeIII 0.755 0.225 0.02 +GSM274998.cel ABC 0.051 0.706 0.243 +GSM274999.cel ABC 0.026 0.677 0.297 +GSM275000.cel GCB 0.436 0.002 0.562 +GSM275001.cel ABC 0.101 0.888 0.01 +GSM275002.cel ABC 0.277 0.663 0.06 +GSM275003.cel ABC 0.017 0.509 0.474 +GSM275004.cel GCB 0.045 0.19 0.764 +GSM275005.cel GCB 0.115 0 0.885 +GSM275006.cel GCB 0.095 0.004 0.901 +GSM275007.cel GCB 0.114 0 0.885 +GSM275008.cel GCB 0.113 0 0.887 +GSM275009.cel GCB 0.023 0.158 0.819 +GSM275010.cel ABC 0.135 0.803 0.062 +GSM275011.cel ABC 0.09 0.905 0.005 +GSM275012.cel TypeIII 0.602 0.031 0.367 +GSM275013.cel ABC 0.346 0.617 0.037 +GSM275014.cel ABC 0.142 0.834 0.023 +GSM275015.cel ABC 0.397 0.533 0.07 +GSM275016.cel GCB 0.086 0.003 0.911 +GSM275017.cel ABC 0.036 0.786 0.177 +GSM275018.cel GCB 0.03 0.151 0.818 +GSM275019.cel GCB 0.018 0.101 0.881 +GSM275020.cel GCB 0.137 0 0.863 +GSM275021.cel TypeIII 0.73 0.167 0.104 +GSM275022.cel ABC 0.116 0.884 0 +GSM275023.cel TypeIII 0.864 0.119 0.017 +GSM275024.cel GCB 0.382 0.053 0.565 +GSM275025.cel ABC 0.142 0.841 0.017 +GSM275026.cel TypeIII 0.855 0.008 0.138 +GSM275027.cel ABC 0.097 0.902 0 +GSM275028.cel ABC 0.037 0.791 0.172 +GSM275029.cel ABC 0.082 0.488 0.429 +GSM275030.cel GCB 0.213 0.002 0.784 +GSM275031.cel ABC 0.198 0.798 0.003 +GSM275032.cel ABC 0.183 0.789 0.028 +GSM275033.cel GCB 0.135 0 0.865 +GSM275034.cel GCB 0.387 0.003 0.61 +GSM275035.cel ABC 0.184 0.77 0.046 +GSM275036.cel ABC 0.174 0.817 0.009 +GSM275037.cel ABC 0.415 0.562 0.023 +GSM275038.cel TypeIII 0.675 0.02 0.304 +GSM275039.cel ABC 0.092 0.897 0.011 +GSM275040.cel GCB 0.086 0.003 0.911 +GSM275041.cel GCB 0.096 0.24 0.664 +GSM275042.cel TypeIII 0.505 0.471 0.024 +GSM275043.cel TypeIII 0.873 0.011 0.116 +GSM275044.cel ABC 0.359 0.378 0.262 +GSM275045.cel ABC 0.162 0.805 0.033 +GSM275046.cel GCB 0.086 0.003 0.911 +GSM275047.cel GCB 0.02 0.138 0.843 +GSM275048.cel GCB 0.121 0.059 0.82 +GSM275049.cel GCB 0.101 0.239 0.66 +GSM275050.cel TypeIII 0.52 0.386 0.094 +GSM275051.cel GCB 0.148 0.039 0.813 +GSM275052.cel TypeIII 0.602 0.062 0.336 +GSM275053.cel GCB 0.282 0.288 0.429 +GSM275054.cel GCB 0.011 0.102 0.887 +GSM275055.cel TypeIII 0.51 0.059 0.431 +GSM275056.cel ABC 0.041 0.542 0.417 +GSM275057.cel TypeIII 0.735 0.033 0.232 +GSM275058.cel GCB 0.159 0.254 0.587 +GSM275059.cel ABC 0.068 0.479 0.453 +GSM275060.cel GCB 0.139 0.042 0.82 +GSM275061.cel GCB 0.109 0.235 0.656 +GSM275062.cel GCB 0.015 0.213 0.772 +GSM275063.cel TypeIII 0.476 0.117 0.407 +GSM275064.cel TypeIII 0.761 0.063 0.176 +GSM275065.cel GCB 0.17 0.071 0.76 +GSM275066.cel TypeIII 0.839 0.009 0.152 +GSM275067.cel TypeIII 0.844 0.022 0.133 +GSM275068.cel TypeIII 0.611 0.128 0.261 +GSM275069.cel GCB 0.023 0.134 0.844 +GSM275070.cel TypeIII 0.822 0.034 0.144 +GSM275071.cel GCB 0.131 0.079 0.79 +GSM275072.cel GCB 0.331 0.069 0.6 +GSM275073.cel TypeIII 0.405 0.327 0.268 +GSM275074.cel GCB 0.012 0.212 0.776 +GSM275075.cel TypeIII 0.739 0.032 0.229