Datasets
Models
Downloads: 1
| # | Adult Decompensation Code Map (This code map references Will's CS code map) | Unnamed: 1 | Unnamed: 2 | Unnamed: 3 | Unnamed: 4 | Unnamed: 5 | Unnamed: 6 | Unnamed: 7 | Unnamed: 8 | Unnamed: 9 | Unnamed: 10 | TO DO things are colored blue |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | Overview | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan | differences from model V1.0 (code map_v1) are colored orange |
| 2 | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan |
| 3 | This document outlines the code and associated data files for "start-to-finish" process of data curation for each of the following: | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan |
| 4 | nan | adult inpatient encounter cohort | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan |
| 5 | nan | patient features | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan |
| 6 | nan | model outcome | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan |
| 7 | nan | model labels and features | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan |
| 8 | nan | ICU admission model | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan |
| 9 | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan |
| 10 | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan |
| 11 | data_pipeline | nan | cohort | nan | model_features(design_matrix) | nan | nan | model | nan | nan | nan | nan |
| 12 | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan |
| 13 | nan | nan | patient features | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan |
| 14 | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan |
| 15 | nan | nan | outcome | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan |
| 16 | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan |
| 17 | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan |
| 18 | nan | Raw data pipeline files(db file) are used to identify cohort encounter ids that meet specific criteria: all adult inpatient encounters at DUH, DRH, DRAH 10/2015 - 08/2018 | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan |
| 19 | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan |
| 20 | nan | Features(data elements) are pulled from raw data pipeline files using cohort patient ids | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan |
| 21 | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan |
| 22 | nan | Generate outcome label and timestamp from raw data pipeline files: first unanticipated ICU admission during each encounter's hospital stay for Model V2.0 | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan |
| 23 | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan |
| 24 | nan | (TO DO) Generate design matrix for the model | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan |
| 25 | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan |
| 26 | nan | (TO DO) adult decompensation model (ICU admission within 24 hours) | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan |
| 27 | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan |
| 28 | Last Revision: Dec 4, 2019 | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan |
| 29 | Ziyuan Shen | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan | nan |