Datasets
Models
Downloads: 1
111 lines (111 with data), 20.8 kB
§
9Ðe> ã óì d dl Zd dlZd dlZd dlZd dlZd dlZd dl m
Z
d dl m Z d dl
Z
d dlmZ d dlmZ d dlZd dlZd dlZd dlmZ d Zd Zd Zd Zd
Z d Z d Z d
Z d Z d Z!d Z"d Z#d Z$d Z%d Z&dS )é N)Ú PyntCloud)Úresize)Útqdm)ÚImagec óP | j \ }}}t j | |||z f¦ « }|S ©N)ÚshapeÚnpÚreshape)Úarray_3dÚdepthÚheightÚwidthÚarray_2ds ú/Users/asif/Documents/Deep Learning Musculoskeletal Automatic Segmentation/Preprocessing Medical Data Pipeline/preprocessing.pyÚflatten_3d_to_2dr s1 à#>ÑE65õ z( U¨F°U©NÐ$;Ñ<Ô<Hà Oó c óî | d¦ « }t |¦ « dk rd S |d ¦ « } t |d ¦ « }n# t $ r Y d S w xY w| d|d}|S )NÚ_é éþÿÿÿr Ú03d)ÚsplitÚlenÚupperÚintÚ
ValueError)Ú input_stringÚpartsÚprefixÚ number_partÚ
new_strings r Útransform_stringr# s Ø × Ò sÑ #Ô #Eå
5zzA~~Øtà
2Y__Ñ
Ô
FðÝ% (mm øÝ ð ð ð Øttðøøøð Ð.Ð.[Ð.Ð.Ð.JØ Ðs ÁA Á
A*Á)A*c ó> g }| D ]}| |¦ « |S r )Úextend)ÚarrÚ flattenedÚrows r Úflatten_2d_arrayr) - s3 ØIØð ð Ø×ÒÑ Ô Ð Ð Ø Ðr c ót g }t j | ¦ « D ] \ }}}|D ]}| |¦ « !|S r )ÚosÚwalkÚappend)Ú directoryÚ folder_namesÚrootÚdirsÚfilesÚfolders r Ú ListFoldersr4 5 sX ØLÝ W YÑ /Ô /ð (ð (ÑdEØð (ð (FØ × Ò Ñ 'Ô 'Ð 'Ð 'ð (à Ðr c ó² g }t j | ¦ « }t |¦ « }|D ]®}t j | |¦ « }t j |¦ « rm| d¦ « rX t j |¦ « }| |¦ « # t j
j $ r t d| d¦ « Y ªw xY w¯|S )Nz.dcmzSkipping file: z . It is not a valid DICOM file.)
r+ ÚlistdirÚsortedÚpathÚjoinÚisfileÚendswithÚpydicomÚdcmreadr- ÚerrorsÚInvalidDicomErrorÚprint)r. Ú dicom_filesr2 Ú sorted_filesÚfilenameÚfilepathÚ
dicom_files r Úread_dicom_filesrF < së ØKÝ JyÑ !Ô !EÝ%==Là ð Sð SÝ7<< ¨8Ñ4Ô4Ý
7>>(Ñ #Ô #ð S¨×(9Ò(9¸&Ñ(AÔ(Að Sð
SÝ $_¨XÑ 6Ô 6
Ø×"Ò" :Ñ.Ô.Ð.Ð.øÝ>Ô3ð
Sð
Sð
SÝÐQ¨ÐQÐQÐQÑRÔRÐRÐRÐRð
Søøøøà Ðs Á?)B)Â)'CÃCc óz t j | ¦ « }|dz }|dz }|dz }d||dfz }t |¦ « d S )Ni zMemory usage of %s: %d %s.ÚMB)ÚsysÚ getsizeofr@ )ÚvariableÚ
variable_nameÚ
size_in_bytesÚ
size_in_kbÚ
size_in_mbÚ
size_in_gbÚmessages r Ú
get_ram_usagerR K sO ÝM (Ñ+Ô+MØ Ñ%JØdÑ"JØdÑ"JØ*¨m¸ZÈÐ-NÑNGÝ 'NNNNNr c ó2 t j | |¬¦ « }|S )N©Úaxis)r
Úsqueeze)Úarray_4drU r s r Úconvert_4d_to_3drX S s Ýz(¨Ð.Ñ.Ô.HØ Or c ó4 t j d¬¦ « }| dd¬¦ « }| | ||d¬¦ « | d¦ « | d ¦ « | d
¦ « t j ¦ « d S ) N)é rZ )Úfigsizeéo Ú3d)Ú
projectionÚblue)ÚcÚXÚYÚZ)ÚpltÚfigureÚ add_subplotÚscatterÚ
set_xlabelÚ
set_ylabelÚ
set_zlabelÚshow)ÚxÚyÚzÚfigÚaxs r Ú plot_3d_datarq V s å
*VÐ
$Ñ
$Ô
$Cà ¨ Ñ .Ô .BØJJq!Q&JÑ!Ô!Ð!ØMM#ÑÔÐØMM#ÑÔÐØMM#ÑÔÐÝHJJJJJr c ó | t j | ¦ « z } |t j |¦ « z }d}|| z d|z
|z z }|S )Ng à?é )r
Úmax)Úimage1Úimage2ÚalphaÚsuperimposed_images r Úsuperimpose_imagesry ` sI Ø
bfVnnÑ
$FØ
bfVnnÑ
$FØ EØ ¨1¨u©9¸Ñ*>Ñ>ÐØ Ð r c ó¤ t d|¦ « g }g }g }g }g }g }| d |¦ « z }t |¦ « }t t |¦ « ¦ « D ]f} || j t
j || j ¦ « z }
| |
¦ « t dt
j |
¦ « ¦ « g| |¦ « t |¦ « } t
j
| ¦ « } t d| ¦ « ¦ « | d |¦ « z }t t |¦ « ¦ « D ]b} | || j ¦ « | || j ¦ « | || j
¦ « ct j |g d¢¬¦ « } | S )NzPatient Scan Data: z/Raw DICOM MRI Scans/{}ú#Max pixel value in image stack is: z/{}©rl rm rn ©Úcolumns)r@ ÚformatrF Úranger Ú pixel_arrayr
rt r- r) ÚarrayÚImagePositionPatientÚImageOrientationPatientÚ PixelSpacingÚpdÚ DataFrame)
Ú
scans_pathÚfoldersÚscan_pixel_dataÚscan_coordinate_dataÚsingle_scan_pixel_dataÚscan_orientation_dataÚscan_pixelspacing_dataÚsingle_paitent_scans_pathrA ÚiÚnormalized_dataÚtraining_scansÚ
coord_datas
r ÚReadIn_MRIScans_Masksr h sÐ Ý Ð
Ñ)Ô)Ð)ØOØ ÐØ ÐØ ÐØ ÐØ Ðà!+Ð.G×.NÒ.NÈwÑ.WÔ.WÑ!WÐ Ý"Ð#<Ñ=Ô=Kõ C Ñ$Ô$Ñ
%Ô
%ð Nð NØ& q>Ô5½¼¸{È1¼~Ô?YÑ8ZÔ8ZÑ[Ø ×%Ò% oÑ6Ô6Ð6Ý
Ð3µR´V¸OÑ5LÔ5LÑMÔMÐMÐMØ×ÒÐ1Ñ2Ô2Ð2å% oÑ6Ô6NÝXnÑ-Ô-NÝ Ð
/° ×1CÒ1CÑ1EÔ1EÑFÔFÐFð ",¨e¯lªl¸7Ñ.CÔ.CÑ!CÐ Ý
C Ñ$Ô$Ñ
%Ô
%ð Cð CØ ×#Ò# K°¤NÔ$GÑHÔHÐHØ ×$Ò$ [°¤^Ô%KÑLÔLÐLØ ×%Ò% k°!¤nÔ&AÑBÔBÐBÐBå Ð 2¸O¸O¸OÐLÑLÔLJØ Ðr c óô t j d | ¦ « ¦ « }t j |j g d¢¬¦ « }| dd¬¦ « }| d¬¦ « }t d t j
|j d
d |j d d z
¦ « ¦ « t d
t j
|j d
d |j d d z
¦ « ¦ « |d d ¦ « |d< |
d¦ « |
d¦ « t j |d d z ¦ « d z |d< |
d¦ « t j ||d¬¦ « }| d¦ « ¦ « ¦ « }t% t' |d dgt) |¦ « z ¦ « ¦ « }|d |¦ « d¦ « |d< |j |d dk j d }|j |d dk j d
}||z
dz } t d|¦ « t d|¦ « t d| ¦ « |
d¦ « |
d¦ « |
d ¦ « ||| |fS ) NúSC:/Users/GGPC/OneDrive/Desktop/Part 4 Project/Part4Project/SegmentationMasks/{}.plyr| r} rn F)Ú ascendingT)ÚdropzHeight of Paitent in mm: éÿÿÿÿr r z%Length of Paitent AOI (tibia) in mm: c ó" t | d¦ « S )Nrs )Úround)rl s r ú<lambda>z'MappingCoordinateData.<locals>.<lambda> s µe¸A¸q±k´k r zExactMaskCoordinateData.csvzExactScanCoordinateData.csvz RoundedMaskCoordinateData.csv)ÚonÚAOIzOutside of AOIÚSegmentationRegionSlicers úAOI Slice Start: úAOI Slice End: úAOI Slice Range: ztibia_mri_coord.csvzmergedcoordsystems.csvz condensedmergedcoordsystems.csv)ÚtrimeshÚ load_meshr r r ÚverticesÚ sort_valuesÚ reset_indexr@ r
ÚabsÚilocÚapplyÚto_csvr ÚmergeÚgroupbyÚmedianÚdictÚzipr ÚmapÚfillnaÚlocÚindex)
Úfilename_labelr Úmeshr¥ Ú merged_dfÚ condensed_dfÚ mapping_dictÚslices_aoi_startÚslices_aoi_endÚslice_aoi_ranges
r ÚMappingCoordinateDatar½ sî å Ô Ð s× {Ò {ð }Kñ Lô Lñ Mô MDõ |DM°?°?°?ÐCÑCÔCHð
×#Ò# C°UÐ#Ñ;Ô;HØ×#Ò#¨4Ð#Ñ0Ô0Hå Ð
%¥r¤v¨j¬o¸bÔ.AÀ!Ô.DÀzÄÐWXÔGYÐZ[ÔG\Ñ.\Ñ']Ô']Ñ^Ô^Ð^Ý Ð
1µ2´6¸(¼-ÈÔ:KÈAÔ:NÐQYÔQ^Ð_`ÔQaÐbcÔQdÑ:dÑ3eÔ3eÑfÔfÐfà o×+Ò+Ð,AÐ,AÑBÔBJsOð9ØÐ5Ñ6Ô6Ð6Ø×ÒÐ7Ñ8Ô8Ð8õ HX c]¨QÑ .Ñ/Ô/°!Ñ3HSMð9ØÐ7Ñ8Ô8Ð8å X°#Ð6Ñ6Ô6Ià ×$Ò$ SÑ)Ô)×0Ò0Ñ2Ô2×>Ò>Ñ@Ô@LåL¨Ô -°¨wµs¸<Ñ7HÔ7HÑ/HÑIÔIÑJÔJLà,6°s¬O×,?Ò,?À Ñ,MÔ,M×,TÒ,TÐUeÑ,fÔ,fJÐ(Ñ)à" zÐ2KÔ'LÐPUÒ'UÔVÔ\Ð^_Ô`ÐØ n ZÐ0IÔ%JÈeÒ%SÔTÔZÐ\^Ô_NØ%Ð(8Ñ8¸1Ñ<OÝ Ð
Ð /Ñ0Ô0Ð0Ý Ð
^Ñ,Ô,Ð,Ý Ð
Ñ/Ô/Ð/ð?Ø×ÒÐ/Ñ0Ô0Ð0Ø×ÒÐ1Ñ2Ô2Ð2Ø×ÒÐ =Ñ>Ô>Ð>ð ^¨_¸jÐ HÐHr c ó2 t j d | ¦ « ¦ « }t j |j g d¢¬¦ « }t j |j g d¢¬¦ « }t ||¬¦ « }|ddg}| d|d |d |d
¬ ¦ « }|j |
¦ « |¦ « }t j
|d ¬
¦ « }t ||d¬¦ « }t j |dk d d¦ « }|S )Nr r| r} )Úv1Úv2Úv3)Úpointsr¶ é Ú voxelgridr rs r )Ún_xÚn_yÚn_z)r r rs )ÚaxesF)Ú
anti_aliasing)r£ r¤ r r r r¥ Úfacesr Ú
add_structureÚ
structuresÚget_feature_vectorr r
Ú transposer Úwhere) rµ r¼ r¶ r¥ rÊ ÚcloudÚdesired_resolutionÚ voxelgrid_idÚ
voxel_grids r ÚVoxelisationMaskrÔ Æ sD å Ô Ð s× {Ò {ð }Kñ Lô Lñ Mô MDõ |DM°?°?°?ÐCÑCÔCHÝ LÐ-?Ð-?Ð-?Ð @Ñ @Ô @EÝ X¨EÐ 2Ñ 2Ô 2Eð *¨3°Ð4Ðð ×&Ò& {Ð8JÈ1Ô8MÐSeÐfgÔShð oAð BCô oDÐ&ñ Eô ELØÔ! ,Ô/×BÒBÑDÔD×LÒLÐM_Ñ`Ô`Jõ j¨yÐ9Ñ9Ô9Jõ
Ð$6ÀeÐLÑLÔLJå* q.¨!¨QÑ/Ô/Jð Ðr c óê t j d | |¦ « ¦ « }t j |¦ « }| ¦ « }t j |¬¦ « }|d d d
d d
d d
f }t j |dk dd¦ « }t j |¦ « }t j
t j |dk ¦ « ¦ « }|j dk rt |d ¦ « }nd }|j dk rt |d ¦ « }nd }t d|d ¦ « t d|d ¦ « t d|d |d z
dz ¦ « ||d |d fS ) Nz6{}/Raw NIFITI Segmentation Masks (3D Slicer Output)/{})Údatar r rs r r¡ r¢ )ÚsitkÚ ReadImager ÚGetArrayFromImageÚ
GetSpacingr r r
rÏ r rÎ ÚnonzeroÚsizeÚtupler@ )Úbasedirrµ Úseg_masks_15A_tibiaÚseg_masks_15A_tibia_dataÚvoxel_dimensionsÚindicesÚfirst_non_zero_index_2dÚlast_non_zero_index_2ds r Ú MaskCreationrå ç s Ý .Ð*b×)jÒ)jÐkrð uCñ *Dô *Dñ Eô EÐÝ #Ô 5Ð6IÑ JÔ JÐ Ø*×5Ò5Ñ7Ô7ÐÝ|Ð+;Ð<Ñ<Ô<Ðà 7¸¸¸"¸¸a¸a¸aÀÀÀ¸
Ô CÐ Ý !xÐ(@ÀAÒ(EÀqÈ!Ñ LÔ LÐ å !xÐ(@Ñ AÔ AÐ Ýl2:Ð&>À!Ò&CÑDÔDÑEÔEGØ|aÒÐÝ"'¨°¬
Ñ"3Ô"3Ð Ð à"&Ð à|aÒÐÝ!& w¨r¤{Ñ!3Ô!3Ð Ð à!%Ð å Ð
Ð 6°qÔ 9Ñ:Ô:Ð:Ý Ð
Ð 3°AÔ 6Ñ7Ô7Ð7Ý Ð
Ð 6°qÔ 9Ð<SÐTUÔ<VÑ VÐYZÑ ZÑ\Ô\Ð\à #Ð%<¸QÔ%?ÐAWÐXYÔAZÐ ZÐZr c
óÎ t j d | t |d d¦ « d ¦ « ¦ « ¦ « }t j d | |d d¦ « d |d ¦ « ¦ « }| ¦ « }| ¦ « } | t |¦ « d d
d d
df }
|t |¦ « d d
d d
df } t
|
| ¦ « } t j | d¬¦ « t j d ||d ¦ « ¦ « t j
d ¦ « t j ¦ « |d
k rßt j d ||¦ « ¦ « }
|
¦ « }| |d d
d d
df }
||d d
d d
df } t
|
| ¦ « } t j | d¬¦ « t j d ||j d |¦ « ¦ « t j
d ¦ « t j ¦ « d S d S )
Nz${}/nnUNet Data/scans/msk_00{}.nii.gzr r rs z!{}/nnUNet Data/masks/{}/{}.nii.gzÚgray)Úcmapz1Validating Scan & Mask (Binary) on Slice {} of {}ÚoffFz{}/msk_00{}.nii.gzz>Validating Scan & Mask (Multiclass) on Slice {}/{} of msk_00{})
ÚnibÚloadr r r Ú get_fdatary rd ÚimshowÚtitlerU rk r )rÞ Ú colab_fnameÚ
slice_idx_binÚslice_idx_multiÚmulticlass_dirÚ
mask_indexÚ nii_img_scanÚ nii_img_maskÚ mask_dataÚ scan_dataru rv rx Únii_img_mask_multiclassÚmulticlass_mask_datas r ÚVisualValidationMSKrú s Ý8Ð C× KÒ KÈGÕUXÐ[fÐghÔ[i×ZpÒZpÐqtÑZuÔZuÐwxÔYyÑUzÔUzÑ {Ô {Ñ|Ô|LÝ8Ð @× HÒ HÈÐT_Ð`aÔTb×SiÒSiÐjmÑSnÔSnÐpqÔRrÐs~ð @Aô tBñ Cô Cñ Dô DLà ×&Ò&Ñ(Ô(IØ ×&Ò&Ñ(Ô(IØ
s=Ñ)Ô)¨1¨1¨1¨a¨a¨a°Ð2Ô
3FØ
s=Ñ)Ô)¨1¨1¨1¨a¨a¨a°Ð2Ô
3FÝ+¨F°FÑ;Ô;ÐÝJÐ!¨Ð/Ñ/Ô/Ð/ÝIÐB×JÒJÈ=ÐZeÐfgÔZhÑiÔiÑjÔjÐjÝHUOOOÝHJJJà%Ò Ð Ý"%¤(Ð,@×+HÒ+HÈ ÐYcÑ+dÔ+dÑ"eÔ"eÐ Ø 6× @Ò @Ñ BÔ BÐ Ø?¨A¨A¨A¨q¨q¨q°!Ð3Ô4Ø% o°q°q°q¸!¸!¸!¸QÐ&>Ô?Ý /°¸Ñ ?Ô ?ÐÝ
Ð%¨FÐ3Ñ3Ô3Ð3Ý ÐS×[Ò[Ð\kð nBô nHð IJô nKð MWñ Xô Xñ Yô Yð YÝ Ý
ð Ð r c ó¤ g g g g g f\ }}}} }
|g}t d¦ « t d|¦ « t |¦ « D ]b\ } } t d¦ « t dd | ¦ « ¦ « t | || ¦ « }
t | | ¦ « \ }}}t t
j ||z
¦ « dz ¦ « |z }|dk rg| dk r|||dz
}|
||dz
}nFt
j ||||dz
fd¬ ¦ « }t
j ||
||dz
fd¬ ¦ « }|d
k r*| |¦ « | |
¦ « | |¦ « | |¦ « t d¦ « dt
j
|¦ « }t
j
|¦ « }| d ¦ « }|d z }t
j |dk dd¦ « }t d
¦ « t d|
¦ « ¦ « t d¦ « t dt
j |¦ « ¦ « t d¦ « |d
k rt
j |t! |¦ « |j d z ddf¦ « }t
j |t! |¦ « |j d z ddf¦ « }t
j |d¬ ¦ « }t
j |d¬ ¦ « }|dk r,t
j |d¬ ¦ « }t
j |d¬ ¦ « }|dk rbt
j |j d dddft j ¬¦ « }t+ |j d ¦ « D ]e}||d d
d d
df }t- j |¦ « }| dt, j ¦ « }t
j
|¦ « ||d d
d d
df< ft
j |j d dddft j ¬¦ « }t+ |j d ¦ « D ]e}||d d
d d
df }t- j |¦ « }| dt, j ¦ « }t
j
|¦ « ||d d
d d
df< f|}|}t d|j ¦ « t d|j ¦ « |||fS )Nú
z+Patient Scan Data Folders Included in Run: zSegmentation Mask: z{}r Tr rs rT FÚfloat32g ào@zScans Normalized! [0-1]r{ zMasks Binarised! [0,1]zLabels in the mask are : rà r é )Údtype)rþ rþ z,Training Scans Input Shape (Full 3D Stack): z,Training Masks Input Shape (Full 3D Stack): )r@ Ú enumerater r rå r r
r¨ Ú concatenater- r ÚastyperÏ rt Úuniquer r r Ú expand_dimsÚemptyrý r r Ú fromarrayr ÚBILINEARÚuint8)r Úfilename_labelsr Útotal_slices_raw_dataÚ DataOnlyAOIÚCroppingÚtrain_mask_tibia_labelsr Ústart_slices_aoiÚend_slices_aoiÚslice_aoi_rangesr´ rµ Ú
training_scanrà rº r» Úmedian_aoi_indexÚtraining_scans_resizedr Ú input_imageÚ pil_imageÚ
resized_imageÚ train_mask_tibia_labels_resizeds r Ú
preprocessingr se ØceÐgiÐkmÐoqÐsuÐcuÑ_Ð^Ð-=¸~ÐO_Ø&Ð'OÝ $KKKÝ Ð
7¸ÑAÔAÐAå!*¨?Ñ!;Ô!;ð ñ Ñ ~Ý
d Ý
Ð# T§[¢[° Ñ%@Ô%@ÑBÔBÐBå-¨j¸'À%¼.ÑIÔI
ÝEQÐR\Ð^lÑEmÔEmÑBÐ Ð"2°NÝ rv nÐ7GÑ&GÑ HÔ HÈ1Ñ LÑMÔMÐP`Ñ`Ðà $Ò Ð Ø
Ø*BÐDTÐWeÐfgÑWgÐChÔ*iÐ'Ø!.Ð0@À>ÐRSÑCSÐ/TÔ!Uå*,¬.Ð:QÐSkÐm}ð AOð PQñ AQð mRô TSð :Tð [\ð +]ñ +]ô +]Ð'Ý!#¤ ° À ÐP`ÐcqÐrsÑcsÐOtÔAuÐ0vÐ}~Ð!Ñ!Ô!à 5Ò Ð Ø #× *Ò *Ð+CÑ DÔ DÐ DØ × !Ò ! -Ñ 0Ô 0Ð 0à× Ò Ð 0Ñ1Ô1Ð1Ø× Ò nÑ-Ô-Ð-å
d å hÐ'>Ñ ?Ô ?ÐÝXnÑ-Ô-Nð $×*Ò*¨9Ñ5Ô5NØdÑNÝ hÐ'>À!Ò'CÀQÈÑ JÔ JÐÝ Ð
#Ñ$Ô$Ð$Ý Ð
/° ×1CÒ1CÑ1EÔ1EÑFÔFÐFÝ Ð
"Ñ#Ô#Ð#Ý Ð
%¥r¤yÐ1HÑ'IÔ'IÑJÔJÐJÝ $KKKàuÒ Ð Ý NµS¸±\´\ÀNÔDXÐYZÔD[Ñ5[Ð]`ÐbeÐ4fÑgÔgÝ"$¤*Ð-DÅsÈ?ÑG[ÔG[Ð^uÔ^{Ð|}Ô^~ÑG~ð ADð FIð GJñ #Kô #KÐ Ý ¨¸RÐ@Ñ@Ô@Ý"$¤.Ð1HÈrÐ"RÑ"RÔ"RÐ àtÒÐÝ ¨¸RÐ@Ñ@Ô@Ý"$¤.Ð1HÈrÐ"RÑ"RÔ"RÐ ð DÒÑå!#¤¨>Ô+?ÀÔ+BÀCÈÈaÐ*PÕXZÔXbÐ!cÑ!cÔ!cÐ Ý~Ô+¨AÔ.Ñ/Ô/ð Ið IAØ(¨¨A¨A¨A¨q¨q¨q°!¨Ô4KÝ ¨ Ñ4Ô4IØ %× ,Ò ,¨Z½¼ Ñ HÔ HMÝ13´¸-Ñ1HÔ1HÐ " 1 a a a¨¨¨¨A :Ñ .Ð .õ +-¬(Ð4KÔ4QÐRSÔ4TÐVYÐ[^Ð`aÐ3bÕjlÔjrÐ*sÑ*sÔ*sÐ'ÝÐ.Ô4°QÔ7Ñ8Ô8ð Rð RAØ1°!°Q°Q°Q¸¸¸¸1°*Ô=KÝ ¨ Ñ4Ô4IØ %× ,Ò ,¨Z½¼ Ñ HÔ HMÝ:<¼(À=Ñ:QÔ:QÐ +¨A¨q¨q¨q°!°!°!°Q¨JÑ 7Ð 7à/Ø"AÐ å Ð
8¸.Ô:NÑOÔOÐOÝ Ð
8Ð:QÔ:WÑXÔXÐXà Ð2Ð4DÐ DÐDr )'Únumpyr
r+ r< Ú SimpleITKr× Úpandasr r£ Ú pyntcloudr Úskimage.transformr rI Úmatplotlib.pyplotÚpyplotrd r Únibabelrê ÚreÚcv2ÚPILr r r# r) r4 rF rR rX rq ry r r½ rÔ rå rú r © r r ú<module>r% sà ðà Ð Ð Ð Ø Ø Ø Ð Ð Ð Ø Ð Ð Ð Ø Ø Ð Ð Ð Ð Ð Ø $Ð $Ð $Ð $Ð $Ð $Ø
Ø Ð Ð Ð Ð Ð Ø Ð Ð Ð Ð Ð Ø Ð Ð Ð Ø Ø
Ø Ð Ð Ð Ð Ð ðð ð ðð ð ð"ð ð ðð ð ð
ð
ð
ð ð ð ðð ð ð ð ð ð ð ð ð ð ð ðF7Ið 7Ið 7Iðv ð ð ðB[ð [ð [ð6ð ð ð4OEð OEð OEð OEð OEr