Diff of /tach.toml [000000] .. [b9e282]

Switch to unified view

a b/tach.toml
1
interfaces = []
2
exclude = [
3
    "**/*__pycache__",
4
    "**/*egg-info",
5
    "LICENSE",
6
    "build",
7
    "docs",
8
    "tests",
9
    "venv",
10
]
11
source_roots = [
12
    "sub-packages/bionemo-core/src",
13
    "sub-packages/bionemo-esm2/src",
14
    "sub-packages/bionemo-evo2/src",
15
    "sub-packages/bionemo-example_model/src",
16
    "sub-packages/bionemo-fw/src",
17
    "sub-packages/bionemo-geneformer/src",
18
    "sub-packages/bionemo-geometric/src",
19
    "sub-packages/bionemo-llm/src",
20
    "sub-packages/bionemo-scdl/src",
21
    "sub-packages/bionemo-size-aware-batching/src",
22
    "sub-packages/bionemo-testing/src",
23
    "sub-packages/bionemo-webdatamodule/src",
24
]
25
26
[[modules]]
27
path = "bionemo.core"
28
depends_on = []
29
30
[[modules]]
31
path = "bionemo.esm2"
32
depends_on = [
33
    "bionemo.core",
34
    "bionemo.llm",
35
]
36
37
[[modules]]
38
path = "bionemo.evo2"
39
depends_on = [
40
    "bionemo.noodles",
41
    "bionemo.core",
42
    "bionemo.llm",
43
]
44
45
[[modules]]
46
path = "bionemo.example_model"
47
depends_on = [
48
    "bionemo.core",
49
    "bionemo.llm",
50
]
51
52
[[modules]]
53
path = "bionemo.fw"
54
depends_on = [
55
    "bionemo.core",
56
    "bionemo.esm2",
57
    "bionemo.geneformer",
58
    "bionemo.geometric",
59
    "bionemo.llm",
60
    "bionemo.noodles",
61
    "bionemo.noodles",
62
    "bionemo.scdl",
63
    "bionemo.size_aware_batching",
64
    "bionemo.webdatamodule",
65
]
66
67
[[modules]]
68
path = "bionemo.geneformer"
69
depends_on = [
70
    "bionemo.core",
71
    "bionemo.llm",
72
    "bionemo.scdl",
73
]
74
75
[[modules]]
76
path = "bionemo.geometric"
77
depends_on = [
78
    "bionemo.core",
79
]
80
81
[[modules]]
82
path = "bionemo.llm"
83
depends_on = [
84
    "bionemo.core",
85
]
86
87
[[modules]]
88
path = "bionemo.noodles"
89
depends_on = [
90
    "bionemo.core",
91
]
92
93
[[modules]]
94
path = "bionemo.scdl"
95
depends_on = [
96
    "bionemo.core",
97
]
98
99
[[modules]]
100
path = "bionemo.size_aware_batching"
101
depends_on = [
102
    "bionemo.core",
103
]
104
105
[[modules]]
106
path = "bionemo.testing"
107
depends_on = [
108
    "bionemo.core",
109
    "bionemo.llm",
110
]
111
112
[[modules]]
113
path = "bionemo.webdatamodule"
114
depends_on = [
115
    "bionemo.core",
116
    "bionemo.llm",
117
]