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+++ b/rna/snakemake/README.txt
@@ -0,0 +1,15 @@
+#################
+## Run locally ##
+#################
+
+snakemake --use-conda --cores 1
+snakemake --forceall --use-conda --cores 1
+snakemake --forceall --use-conda --cores 1 --dry-run
+
+#################################
+## Run on the Babraham cluster ##
+#################################
+
+sbatch -n 1 --mem 5G snakemake --forceall -j 4 --use-conda --latency-wait 90 --cluster "sbatch -n 1 --mem 5G"
+snakemake --forceall -j 4 --use-conda --latency-wait 90 --cluster "sbatch -n 1 --mem 12G"
+snakemake -j 4 --use-conda --latency-wait 90 --cluster "sbatch -n 1 --mem {params.memory}G"
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